Population Genomics of Diapause Phenotypes in European Ips typographus Using High-Throughput RADseq
- Boden und Landökosysteme
- Wasser - Atmosphäre - Umwelt
- Lebensraum und Landschaft
Abstract
Der exakte physiologische und somit reproduktive Zustand zum richtigen saisonalen Zeitpunkt ist ein entscheidender Faktor für das Überleben einer Insektenpopulation. Um dies zu bewerkstelligen haben Insekten eine genetisch vorprogrammierte Periode, welche Diapause genannt wird, entwickelt. Mit Hilfe der Diapause werden die einzelnen Stadien synchronisiert. Der genetische Hintergrund der Diapause soll beim europäischen Buchdrucker mittels Genomanalyse untersucht werden. Ein Anstieg der Temperatur hat schnellere Entwicklungsraten beim Buchdrucker und durch vermehrte Generationen pro Jahr größerere forstwirtschaftliche Schäden zur Folge. Die Genomanalyse Double Digest Restriction Site Associated DNA Sequencing ddRADSeq wird hier verwendet, um 1) die genetische Grundlage der nicht obligaten vs. der obligaten Diapause und 2) die europäischen I. typographus Populationen in Bezug auf Diapauseverhalten zu untersuchen. Öko-physiologisch definierte Individuen, welche unter exakten Temperaturbedingungen herangezogen werden, werden mittels ddRADSeq untersucht. Diese Analyse soll Information zur genetischen Basis des Diapauseverhaltens liefern. Da das Diapauseverhalten eine sehr komplexe Eigenschaft ist, kann nur eine Genomanalyse und somit die Analyse einer sehr hohen Anzahl an Loci Auskunft über dieses Verhalten geben. Die Loci, welche in Bezug auf das Diapauseverhalten einer Selektion unterliegen, werden in Folge bei der Analyse der europäischen Populationen herangezogen um lokale Unterschieden festzustellen. Diese Studie wird neben demographischen Ereignissen auch einen Einblick auf phänotypische Struktur zeigen - somit eine Abschätzung der obligat bzw. nicht obligat diapausierenden Käfer bringen.
- Ips typographus
- Diapause
- New Generation Sequencing
- ddRAD-Seq
- Phylogeographie
Mitarbeiter*innen
Christian Stauffer
Ao.Univ.Prof. Dipl.-Ing. Dr.nat.techn. Christian Stauffer
christian.stauffer@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-91631
Projektleiter*in
01.07.2014 - 31.12.2018
Martin Schebeck
Priv.-Doz. Dr.nat.techn. Martin Schebeck MMSc.
martin.schebeck@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-91617
Projektmitarbeiter*in
01.07.2014 - 31.12.2018
Axel Schopf
Univ.-Prof. i.R. Dr.phil. Axel Schopf
axel.schopf@boku.ac.at
Projektmitarbeiter*in
01.07.2014 - 31.12.2018
BOKU Partner
Externe Partner
Kansas State University_x000D_
Gregory Ragland
Partner