Funktionelle Analyse der ARIADNE Genfamilie in Arabidopsis
Abstract
Die Regulation der Proteinstabilität über Ubiquitin abhängige Proteolyse spielt eine wichtige Rolle bei verschiedenen pflanzlichen Entwicklungsvorgängen, wie z.B. bei der Signalübertragung von Hormonen, im Zellzyklus, während der Embryogenese, Blüten- und Blattentwicklung als auch bei Pflanzen-Pathogeninteraktionen. Die Substratspezifität der posttranslationalen Modifikation mit Ubiquitin wird durch die sogenannten E3 Ubiquitinligasen erreicht, die entweder als monomere oder multimere Komplexe vorkommen. Eine wichtige molekulare Komponente dieser E3 Ubiquitinligasen, ist die Anwesenheit von Proteinen mit einer oder mehreren RING (Really INteresting Gene) -Finger Domänen. In Vorarbeiten haben wir in der Modellpflanze Arabidopsis thaliana die ARIADNE Genfamilie identifiziert. Diese Genfamilie stellt eine neue Klasse von putativen E3 Ubiquitinligasen mit zwei RING-Finger Domänen und einem „in between RING-Finger“ Motif dar (Mladek et al., 2003; www.arabidopsis.org/info/genefamily/ARIADNE.html). Auf Basis von Sequenzvergleichen und einer phylogenetischen Analyse klassifizierten wir die 16 ARIADNE Gene in drei Gruppen, wobei zwei dieser Subklassen pflanzenspezifisch sind. Ziel des Projektes ist die Aufklärung der molekularen Mechanismen, bei denen die ARIADNE Proteine eine Rolle spielen. Die Redundanz der ARIADNE Genfamilie wird mit genetischen, phänotypischen, zellbiologischen und biochemischen Analysen von "knockout" Mutanten überprüft. Die biochemische Bestimmung der E3 Ubiquitinligase Aktivität und Spezifität wird innerhalb bestehender internationaler Kooperationen durchgeführt. Das beantragte Projekte soll integriert werden in das multinational koordinierte funktionelle Arabidopsis Genomprojekt, dessen Ziel die molekulare Charakterisierung jedes Arabidopsis Gens ist.
www.ncbi.nlm.nih.gov
Project staff
Marie-Theres Hauser
ao.Univ.Prof. Dipl.-Ing.Dr.nat.techn. Marie-Theres Hauser
marie-theres.hauser@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-94240
Projektleiter*in
16.08.2005 - 15.08.2008
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