Hans Jürgen Zanghellini
Dipl.-Ing.Dr. Hans Jürgen Zanghellini
Status aktuell nicht an der BOKU tätig
ORCID: 0000-0002-1964-2455, öffnet in neuem Fenster.
AuthorId : 55917373300, öffnet in neuem Fenster.
ResearcherId : A-4635-2017
Projekte
Es wurde 1 Projekt gefunden.
Doktoratskolleg plus "Biomolecular Technology of Proteins"
Projekttyp: Doktoratskolleg
Projektleitung: Oostenbrink Chris
Beteiligte BOKU-Organisationseinheiten: Institut für Nanobiotechnologie (NBT), Institut für Angewandte Genetik und Zellbiologie (IAGZ), Institut für Analytische Chemie , Institut für Biochemie , Institut für Kolloid- und Biogrenzflächenforschung , Institut für Lebensmitteltechnologie, Institut für Mikrobiologie und Mikrobielle Biotechnologie, Institut für Molekulare Modellierung und Simulation , Institut für Umweltbiotechnologie
Gefördert durch: Fonds zur Förderung der wissenschaftlichen Forschung (FWF)
Sub-Projektleiter*in: 01.01.2019 - 31.12.2023
Laufzeit: 01.04.2010 - 31.12.2023
Publikationen
Es wurden 60 Publikationen gefunden.
PeakBot: machine-learning-based chromatographic peak picking
quelle: Bueschl C, Doppler M, Varga E, Seidl B, Flasch M, Warth B, et al. PeakBot: machine-learning-based chromatographic peak picking. Bioinformatics. 2022;38(13):3422-8. doi:https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac344
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Maintenance energy requirements determine metabolic rewiring of Komagataella phaffii at glucose-limited near-zero growth conditions
quelle: Coltman B, Rebnegger C, Gasser B, Zanghellini J. Maintenance energy requirements determine metabolic rewiring of Komagataella phaffii at glucose-limited near-zero growth conditions. In: Austrian Proteomics and Metabolomics Association , editor. Book of Abstracts. 2023.
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Externe Links und Eigenschaften der Publikation:Maintenance energy requirement largely determines metabolic rewiring of Komagataella phaffii at glucose limited near zero growth
quelle: Coltman B, Rebnegger C, Gasser B, Zanghellini J. Maintenance energy requirement largely determines metabolic rewiring of Komagataella phaffii at glucose limited near zero growth. In: EFB , editor. 6th Applied Synthetic Biology in Europe (ASBE VI). 2022.
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Externe Links und Eigenschaften der Publikation:Error propagation in constraint-based modeling of Chinese hamster ovary cells.
quelle: Széliová D, Iurashev D, Ruckerbauer D, Koellensperger G, Borth N, Melcher M, et al. Error propagation in constraint-based modeling of Chinese hamster ovary cells. Biotechnology Journal. 2021;16(4):e2000320. doi:https://doi.org/10.1002/biot.202000320
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Assessing flux rearrangements of an alternate methanol metabolism that enables efficient recombinant protein production in Pichia pastoris
quelle: Coltman B, Zavec D, Mattanovich D, Gasser B, Zanghellini J. Assessing flux rearrangements of an alternate methanol metabolism that enables efficient recombinant protein production in Pichia pastoris. In: ICY , editor. ICY15 meets ICYGMB30. 2021.
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Externe Links und Eigenschaften der Publikation:EFMlrs: a Python package for elementary flux mode enumeration via lexicographic reverse search
quelle: Buchner B, Zanghellini J. EFMlrs: a Python package for elementary flux mode enumeration via lexicographic reverse search. Bmc Bioinformatics. 2021;22(1). doi:https://doi.org/10.1186/s12859-021-04417-9
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Finger sweat analysis enables short interval metabolic biomonitoring in humans.
quelle: Brunmair J, Gotsmy M, Niederstaetter L, Neuditschko B, Bileck A, Slany A, et al. Finger sweat analysis enables short interval metabolic biomonitoring in humans. Nature Communications. 2021;12(1):5993. doi:https://doi.org/10.1038/s41467-021-26245-4
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
The secretome of Pichia pastoris in fed-batch cultivations is largely independent of the carbon source but changes quantitatively over cultivation time
quelle: Burgard J, Gruber-Grunwald C, Altmann F, Zanghellini J, Valli M, Mattanovich D, et al. The secretome of Pichia pastoris in fed-batch cultivations is largely independent of the carbon source but changes quantitatively over cultivation time. Microbial Biotechnology. 2020;13(2):479-94. doi:https://doi.org/10.1111/1751-7915.13499
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Environmental flexibility does not explain metabolic robustness
quelle: Libiseller-Egger J, Coltman B, Gerstl M, Zanghellini J. Environmental flexibility does not explain metabolic robustness. NPJ Syst Biol Appl. 2020;6(1). doi:https://doi.org/10.1038/s41540-020-00155-5
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Robust Analytical Methods for the Accurate Quantification of the Total Biomass Composition of Mammalian Cells.
quelle: Széliová D, Schoeny H, Knez Š, Troyer C, Coman C, Rampler E, et al. Robust Analytical Methods for the Accurate Quantification of the Total Biomass Composition of Mammalian Cells. Methods in Molecular Biology. 2020;2088:119-60. doi:https://doi.org/10.1007/978-1-0716-0159-4_7
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Flux tope analysis: studying the coordination of reaction directions in metabolic networks
quelle: Gerstl M, Muller S, Regensburger G, Zanghellini J. Flux tope analysis: studying the coordination of reaction directions in metabolic networks. Bioinformatics. 2019;35(2):266-73. doi:https://doi.org/10.1093/bioinformatics/bty550
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Dissecting peak broadening in chromatography columns under non-binding conditions
quelle: Iurashev D, Schweiger S, Jungbauer A, Zanghellini J. Dissecting peak broadening in chromatography columns under non-binding conditions. Journal of Chromatography A [Internet]. 2019;1599:55-6. doi:10.1016/j.chroma.2019.03.065
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Genetic and Epigenetic Variation across Genes Involved in Energy Metabolism and Mitochondria of Chinese Hamster Ovary Cell Lines.
quelle: Dhiman H, Gerstl M, Ruckerbauer D, Hanscho M, Himmelbauer H, Clarke C, et al. Genetic and Epigenetic Variation across Genes Involved in Energy Metabolism and Mitochondria of Chinese Hamster Ovary Cell Lines. Biotechnology Journal. 2019;14(7):e1800681. doi:https://doi.org/10.1002/biot.201800681
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Combinatorial in Vitro and in Silico Approach To Describe Shear-Force Dependent Uptake of Nanoparticles in Microfluidic Vascular Models
quelle: Charwat V, Calvo I, Rothbauer M, Kratz S, Jungreuthmayer C, Zanghellini J, et al. Combinatorial in Vitro and in Silico Approach To Describe Shear-Force Dependent Uptake of Nanoparticles in Microfluidic Vascular Models. Analytical Chemistry. 2018;90(6):3651-5. doi:https://doi.org/10.1021/acs.analchem.7b04788
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Designing Optimized Production Hosts by Metabolic Modeling.
quelle: Jungreuthmayer C, Gerstl M, Peña Navarro D, Hanscho M, Ruckerbauer D, Zanghellini J. Designing Optimized Production Hosts by Metabolic Modeling. Methods in Molecular Biology. 2018;1716:371-87. doi:https://doi.org/10.1007/978-1-4939-7528-0_17
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Metabolic engineering of Pichia pastoris.
quelle: Peña D, Gasser B, Zanghellini J, Steiger M, Mattanovich D. Metabolic engineering of Pichia pastoris. Metabolic Engineering. 2018;50:2-15. doi:https://doi.org/10.1016/j.ymben.2018.04.017
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
A mathematical framework for yield (vs. rate) optimization in constraint-based modeling and applications in metabolic engineering
quelle: Klamt S, Muller S, Regensburger G, Zanghellini J. A mathematical framework for yield (vs. rate) optimization in constraint-based modeling and applications in metabolic engineering. Metabolic Engineering. 2018;47:153-69. doi:https://doi.org/10.1016/j.ymben.2018.02.001
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Comprehensive assessment of measurement uncertainty in C-13-based metabolic flux experiments
quelle: Mairinger T, Wegscheider W, Pena D, Steiger M, Koellensperger G, Zanghellini J, et al. Comprehensive assessment of measurement uncertainty in C-13-based metabolic flux experiments. Analytical and Bioanalytical Chemistry. 2018;410(14):3337-48. doi:https://doi.org/10.1007/s00216-018-1017-7
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Making a long story CHOrt: systematic reconstruction of a core metabolic model of CHO
quelle: Galleguillos S, Ruckerbauer D, Hanscho M, Borth N, Zanghellini J. Making a long story CHOrt: systematic reconstruction of a core metabolic model of CHO. In: acib GmbH , editor. esib / 2017. 2017.
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Externe Links und Eigenschaften der Publikation:CHOmine: a browsable resource for Chinese Hamster data
quelle: Hanscho M, Gerstl M, Zanghellini J, Borth N. CHOmine: a browsable resource for Chinese Hamster data. In: acib GmbH , editor. esib / 2017. 2017.
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Externe Links und Eigenschaften der Publikation:
Wissentransfer in die Gesellschaft
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Medienbeiträge
Es wurden 0 Medienbeiträge gefunden.
Vorträge
Es wurden 7 Vorträge gefunden.
Jahr: 2021 - Assessing flux rearrangements of an alternate methanol metabolism that enables efficient recombinant protein production in Pichia pastoris
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Coltman, B; Zavec, D; Mattanovich, D; Gasser, B; Zanghellini, J
Veranstaltung: ICY15 meets ICYGMB30
Datum: 23.08.2021 - 27.08.2021 | Ort: Online
Jahr: 2019 - Quantifying the importance of radial anisotropy in chromatography columns
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Christler, A; Iurashev, D; Schweiger, S; Horvath, J; Duerauer, A; Jungbauer, A;
Veranstaltung: 32nd International Symposium on Preparative and Process Chromatography 2019
Datum: 07.07.2019 - 10.07.2019 | Ort: Baltimore, MD, USA | Veranstalter:
Barr Enterprises
Jahr: 2018 - Cultivation of CHO cells for biomass component quantification
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Knez, Š; Széliová, D; Ruckerbauer, D; Galleguillos, S; Hanscho, M; Zanghellini, J; Borth, N
Veranstaltung: 10th ÖGMBT Annual Meeting & Biophysics Austria Annual Meeting 2018
Datum: 17.09.2018 - 20.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - Determination of maintenance energy in CHO cells
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Thiel, I; Stor, J; Széliová, D; Ruckerbauer, D; Hanscho, M; Zanghellini, J; Borth, N
Veranstaltung: 10th ÖGMBT Annual Meeting & Biophysics Austria Annual Meeting 2018
Datum: 17.09.2018 - 20.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2017 - 13C basierte metabolische Flussanalyse: Ermittlung der Messunsicherheit
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Mairinger, T., Wegscheider, W., Pena Navarro, D., Steiger, M., Koellensperger, G., Zanghellini, J. and Hann, S.
Veranstaltung: ANAKON 2017
Datum: 03.04.2017 - 06.04.2017 | Ort: Tübingen, Germany
Jahr: 2017 - Omics-data integration into the genome-scale metabolic model of Pichia pastoris enables estimation of protein production in capabilities
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Pena-Navarro, D; Haltrich, D; Mattanovich, D; Gasser, B; Zanghellini, J;
Veranstaltung: 9th International Conference on Recombinant Protein Production RPP9 2017
Datum: 23.04.2017 - 25.04.2017 | Ort: Dubrovnik, Croatia
Jahr: 2017 - GC-QTOFMS and GC-MS/MS with EI and CI as highly versatile platforms for metabolomics and metabolic flux analysis in biotechnology
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Mairinger, T., Troyer, C., Wegscheider, W., Zanghellini, J., Mattanovich, D., Koellensperger, G. and Hann, S.
Veranstaltung: 65th ASMS Conference on Mass Spectrometry and Allied Topics 2017
Datum: 04.06.2017 - 08.06.2017 | Ort: Indianapolis, IN, USA
Betreute Hochschulschriften
Es wurden 14 Publikationen gefunden.
Kinetic Study and Global Metabolic Engineering of Glycolysis in Komagataella phaffii CBS7435
Quelle: Rudinatha, Yoshua Donny. Kinetic Study and Global Metabolic Engineering of Glycolysis in Komagataella phaffii CBS7435 [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2025. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC17516361
Dissertation Jahr: 2025
Eigenschaften der Publikation:Metabolic modelling of CHO: From predictions of protein quality to understanding the energy metabolism
Quelle: Štor, Jerneja. Metabolic modelling of CHO: From predictions of protein quality to understanding the energy metabolism [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2024. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC17347482
Dissertation Jahr: 2024
Eigenschaften der Publikation:Constraint-based Pathway Analysis of Metabolic Networks with Lexicographic Reverse Search
Quelle: Buchner, Bianca Allegra. Constraint-based Pathway Analysis of Metabolic Networks with Lexicographic Reverse Search [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2023. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC16995557
Dissertation Jahr: 2023
Eigenschaften der Publikation:Engineering of long-noncoding RNAs in Chinese hamster ovary cells
Quelle: Novak N. Engineering of long-noncoding RNAs in Chinese hamster ovary cells [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2021. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC16569060
Dissertation Jahr: 2021
Eigenschaften der Publikation:Engineering the redox metabolism of Pichia pastoris for improved protein production
Quelle: Peña N, David A. Engineering the redox metabolism of Pichia pastoris for improved protein production [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2020. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC15690703
Dissertation Jahr: 2020
Eigenschaften der Publikation:Analysis and Reconstitution of the Menaquinone Biosynthesis Pathway in Lactobacillus Spp.
Quelle: Watthanasakphuban N. Analysis and Reconstitution of the Menaquinone Biosynthesis Pathway in Lactobacillus Spp. [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2020. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC15690074
Dissertation Jahr: 2020
Eigenschaften der Publikation:Residence time distribution in integrated continuous biomanufacturing
Quelle: Sencar J. Residence time distribution in integrated continuous biomanufacturing [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2020. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC16123595
Dissertation Jahr: 2020
Eigenschaften der Publikation:Improving quantitative genome-scale metabolic modelling of CHO
Quelle: Szeliova D. Improving quantitative genome-scale metabolic modelling of CHO [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2020. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC16122234
Dissertation Jahr: 2020
Eigenschaften der Publikation:Quantification of Water-governed Ligand Binding by Advanced Free-energy Calculation Methods
Quelle: Maurer M. Quantification of Water-governed Ligand Binding by Advanced Free-energy Calculation Methods [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2019. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC15362979
Dissertation Jahr: 2019
Eigenschaften der Publikation:New constraint-based methods to characterize Chinese hamster ovary cell metabolism
Quelle: Galleguillos R, Sarah N. New constraint-based methods to characterize Chinese hamster ovary cell metabolism [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2019. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC15470919
Dissertation Jahr: 2019
Eigenschaften der Publikation:Analysis of multiomics datasets to elucidate the role of Tps1 in Saccharomyces cerevisiae
Quelle: Mattanovich M. Analysis of multiomics datasets to elucidate the role of Tps1 in Saccharomyces cerevisiae [Internet] [Master / Diploma Thesis]. [Austria]: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2019. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC15271954
Diplomarbeit / Masterarbeit Jahr: 2019
Eigenschaften der Publikation:METAHEURISTIC ALGORITHMS FOR OPTIMAL STRAIN DESIGN
Quelle: Nair, Govind Muralidhar. METAHEURISTIC ALGORITHMS FOR OPTIMAL STRAIN DESIGN [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2017. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC12609524
Dissertation Jahr: 2017
Eigenschaften der Publikation:Mass spectrometry based analysis of primary metabolites in 13C based metabolic flux analysis experiments
Quelle: Mairinger T. Mass spectrometry based analysis of primary metabolites in 13C based metabolic flux analysis experiments [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2017. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC12609545
Dissertation Jahr: 2017
Eigenschaften der Publikation:Thermodynamic Metabolic Pathway Analyses Efficient Calculation of Biologically Feasible Elementary Flux Modes
Quelle: Gerstl, Matthias Peter. Thermodynamic Metabolic Pathway Analyses Efficient Calculation of Biologically Feasible Elementary Flux Modes [Internet]. Austria: BOKU - Universität für Bodenkultur Wien; 2015. Available from: http://permalink.obvsg.at/bok/AC10777762
Dissertation Jahr: 2015
Eigenschaften der Publikation:
Community Services
Funktionen für Fachzeitschriften und Gremien/Gesellschaften
Funktion als Herausgeber in wissenschaftlichen Fachzeitschriften
- 2017 -
Scientific Reports,
Editorial Board Member
- 2017 -
Reviewer für wissenschaftliche (peer-reviewte) Fachzeitschriften
- 2017 -
Journal of Bioscience and Bioengineering,
Reviewer
- 2017 -
Microbial Biotechnology,
Reviewer
- 2017 -
Nature Communications,
Reviewer
- 2016 -
Bioinformatics,
Reviewer
- 2013 -
Biotechnology Journal,
Reviewer
- 2017 -
Weitere Peer-Review-Tätigkeiten
Projektbegutachtungen (für Förderorganisationen)
- 2015 -
Agence Nationale de la Recherche (ANR),
- 2015 -