Chris Oostenbrink
Univ.Prof. Dr. Chris Oostenbrink
Naturwissenschaften und Nachhaltige Ressourcen Molekulare Modellierung und Simulation
Standort Muthgasse 18, 1190 Wien
Email chris.oostenbrink@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-89401, 89411, 89419
ORCID: 0000-0002-4232-2556, öffnet in neuem Fenster.
AuthorId : 6602520514, öffnet in neuem Fenster.
ResearcherId : S-8002-2019
Computational Chemistry Strukturbiologie Computational Physics Theoretische Chemie
Forschungsschwerpunkt
Unsere Forschung konzentriert sich auf die Verwendung von Molekulardynamiksimulationen zur Beschreibung molekularer Systeme. Zwei aktuelle Beispiele befassen sich mit (i) der Berechnung thermodynamischer Eigenschaften wie der freien Energie und (ii) der Verwendung maschinell gelernter Potenziale zur Verbesserung der Beschreibung molekularer Wechselwirkungen.
Chemische Gleichgewichte werden durch den Unterschied in der freien Energie zwischen verschiedenen Zuständen bestimmt. Beispiele hierfür sind die Unterschiede in der freien Energie zwischen verschiedenen Konformationen eines Biomoleküls oder der Unterschied in der freien Energie zwischen dem gebundenen und dem ungebundenen Zustand eines Liganden und seinem pharmazeutischen Zielmolekül. In unserer Gruppe entwickeln wir Methoden zur effizienten und genauen Berechnung der freien Energiedifferenzen für solche Prozesse unter Verwendung statistischer Mechanik und molekularer Simulation. In den letzten Jahren haben wir den Ansatz des Accelerated Enveloping Distribution Sampling (A-EDS) entwickelt, um die relativen Bindungsenergien für eine Reihe von Verbindungen zu berechnen.
Molekulare Wechselwirkungen werden durch elektronische Freiheitsgrade bestimmt, die am besten durch die Quantenmechanik beschrieben werden können. Die genaue Berechnung der quantenmechanischen Energien ist jedoch rechnerisch sehr aufwendig. Die Verwendung hybrider QM/MM-Methoden, bei denen nur ein Teil des molekularen Systems mit Quantenchemie (QM) berechnet wird, während der Rest durch Molekülmechanik (MM) beschrieben wird, bietet eine interessante Möglichkeit, die genauesten Methoden dort einzusetzen, wo sie benötigt werden. Wir haben kürzlich einen Ansatz entwickelt, der maschinell gelernte Potenziale nutzt, um die Beschreibung von QM/MM-Wechselwirkungen zu verbessern. Dieser Ansatz heißt BuRNN (Buffer Region Neural Networks).
Laufbahn
- 2025 Departmentleiter des Departments für Naturwissenschaften und Nachhaltige Ressourcen (BOKU University)
- 2019 - 2024 Departmentleiter des Departments für Materialwissenschaften und Prozesstechnik (BOKU University)
- 2015 §98 Professur für Biomolekulare Modellierung und Simulation (BOKU University)
- 2009 Professor für Biomolecular Modeling and Simulation
- 2004 - 2009 Universitätsdozent für Computational Medicinal Chemistry and Toxicology, VU University, Amsterdam
- 2000 - 2004 Dr. Nat.Sci. in Physikalische Chemie, Eidgenössische Technische Hochschule (ETH), Zürich
- 1995 - 2000 Msc in Chemistry, VU University, Amsterdam
- 1995 - 2000 MSc in Pharmaceutical Sciences, VU University Amsterdam
Auszeichnungen
- Jahr: 2010 Auszeichnung: Starting Grant of the European Research Council
Projekte
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Publikationen
Wissentransfer in die Gesellschaft
Medienbeiträge
Vorträge
Es wurden 126 Vorträge gefunden.
Jahr: 2025 - Molecular dynamics simulations of dissolved humic substances: can small molecules maintain stable large associates
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Petrov, D; Oostenbrink, C; Galicia, AE
Veranstaltung: EGU General Assembly 2025
Datum: 27.04.2025 - 02.05.2025 | Ort: Wien, Österreich | Ort: Wien, Österreich | Ort: Wien, Austria. | Ort: Wagramer Straße 5, 1400 Wien, Österreich | Ort: Wagramer Straße 5, 1400 Wien, Österreich | Veranstalter: European Geosciences Union (EGU) | Veranstalter: BOKU University
Jahr: 2025 - Protein structure prediction tools including practical exercise
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C
Veranstaltung: InterTau Summerschool II 2025
Datum: 23.06.2025 - 27.06.2025 | Ort: Nikolsburg, 692 01 Nikolsburg, Tschechien | Veranstalter: CEITEC - Central European Institute of Technology
Jahr: 2025 - Biomolecular simulations of Cytochrome P450 enzymes
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C
Veranstaltung: 24th International Conference on Cytochrome P450 2025
Datum: 30.06.2025 - 04.07.2025 | Ort: Bern, Schweiz | Veranstalter: ICCP
Jahr: 2025 - Sampling from mixed Hamiltonians: accelerated envelopingdistribution sampling
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C
Veranstaltung: CECAM Workshop - Entropy of Soft Matter Systems 2025
Datum: 27.08.2025 - 29.08.2025 | Ort: Klosterneuburg, Klosterneuburg, Österreich | Veranstalter: ISTA
Jahr: 2025 - Molecular dynamics simulation as a tool in protein engineering
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch
Veranstaltung: FEBS Advanced Course 2025
Datum: 30.09.2025 - 30.09.2025 | Ort: Stockholm, 111 29 Stockholm, Schweden | Veranstalter: FEBS
Jahr: 2024 - Buffer region neural networks: A buffered scheme for polarizable QM/MM simulations with machine-learning
Art: Vortrag - Keynote Speaker (eingeladener Vortrag)
Autoren: Oostenbrink, Ch
Veranstaltung: Virapid Workshop 2024
Datum: 26.02.2024 - 29.02.2024 | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter: Universität Wien
Jahr: 2024 - Free energies and enhanced sampling ofbiomolecular systems by accelerating enveloping distribution sampling
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Doctoral Journal Club 2024
Datum: 24.06.2024 - 24.06.2024 | Ort: Graz, Graz, Österreich | Veranstalter: Universität Graz
Jahr: 2024 - Free energies and enhanced sampling from accelerated molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C
Veranstaltung: Seminar Boehringer Ingelheim 2025
Datum: 28.05.2024 - 28.05.2024 | Ort: Wien, Wien, Österreich | Veranstalter: Boehringer Ingelheim
Jahr: 2024 - Free energies and enhanced sampling from accelerated molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Keynote Speaker (eingeladener Vortrag)
Autoren: Oostenbrink, Ch
Veranstaltung: 2024 Workshop on Free Energy Methods in Drug Design
Datum: 13.05.2024 - 15.05.2024 | Ort: Leiden, Niederlande | Veranstalter: Free Energy Methods in Drug Design
Jahr: 2024 - Free energies and enhancedsampling from accelerated molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Odyssey Therapeutics, Inc. 2024
Datum: 21.08.2024 - 21.08.2024 | Ort: Wien, Wien, Österreich | Veranstalter: BOKU University
Jahr: 2023 - Domain interactions investigated by SAXS
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Motycka, B; Csarman, F; Nagy, G; Tscheließnig, R; Oostenbrink, C; Hammel, M; Ludwig, R
Veranstaltung: BioToP Conference 2023
Datum: 19.06.2023 - 20.06.2023 | Ort: Wien | Ort: Wien | Ort: Vienna, AUSTRIA | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter: University of Natural Resources and Life Sciences | Veranstalter: BioToP - BOKU International PhD programme | Veranstalter: Biomolecular Technology of Proteins
Jahr: 2023 - Characterization of soil microaggregates at the microscopic level using molecular dynamics
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Galicia-Andrés, E; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C
Veranstaltung: International Conference of European Clay Groups Association 2023
Datum: 24.07.2023 - 27.07.2023 | Ort: Bari
Jahr: 2023 - Molecular dynamics simulations as a tool in protein engineering
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: FEBS Advanced Course on Computational Approaches to Understanding and Engineering Enzyme Catalysis
Datum: 26.09.2023 | Ort: Zagreb, CROATIA
Jahr: 2023 - Predicting free-energy differences from accelerated envelopingdistribution sampling
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Seminar- Instituto de Biosistemas e Ciências Integrativas
Datum: 16.03.2023 | Ort: Lissabon, PORTUGAL
Jahr: 2023 - Applications of free-energy calculations from molecular dynamicssimulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: EUROPIN Summerschool
Datum: 12.09.2023 | Ort: Vienna, AUSTRIA
Jahr: 2023 - Predicting free-energy differences from accelerated enveloping distribution sampling
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Seminar Max F. Perutz Laboratories
Datum: 29.06.2023 | Ort: Vienna, AUSTRIA
Jahr: 2023 - A buffered scheme for polarizableQM/MM simulations with machine-learning
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: SIMPLAIX Workshop on "Machine Learning for Multiscale MolecularModeling",
Datum: 02.05.2023 - 04.05.2023 | Ort: Heidelberg, DEUTSCHLAND
Jahr: 2022 - Hot, Hotter, BuRNN: A new scheme for polarizable QM/MMsimulations with machine-learning
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: ISQBP Meeting
Datum: 11.07.2022 | Ort: Innsbruck, Austria
Jahr: 2022 - Molecular Modeling and Simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Central European Institute of Technology
Datum: 24.06.2022 | Ort: Brno, CZ
Jahr: 2022 - Modelling of soil organic matter and its interactions with clay minerals
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Gerzabek, M.H.; Galicia Andres; E., Escalona, Y.; Grancic, P; Petrov, D.; Tunega, D; Oostenbrink, C.
Veranstaltung: Jahrestagung der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft DBG 2022
Datum: 05.09.2022 - 08.09.2022 | Ort: Trier, Germany
Jahr: 2022 - Molecular scale view at organo–mineral aggregates
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Galicia–Andrés, E; Oostenbrink, C; Gerzabek, MH; Tunega, D
Veranstaltung: 22nd World Congress of Soil Sciences 2022
Datum: 31.07.2022 - 05.08.2022 | Ort: Glasgow, Scotland, UK
Jahr: 2021 - Understanding of adsorption and degradation of halogenated hydrocarbons at mineral surfaces
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: de Azevedo Barbosa, A.C.; Tunega, D.; Gerzabek, M.H.; Oostenbrink, C.
Veranstaltung: 6. DWB Student Conference 2021 - Forest & Soil Science update
Datum: 17.05.2021 | Ort: Vienna, Austria | Ort: Online | Veranstalter: Depertment of Forest and Soil Sciences, BOKU
Jahr: 2021 - Free energies from molecular simulations: force fields and molecular interactions
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: 5th International Symposium on Bioinformatics
Datum: 15.12.2021 | Ort: Online
Jahr: 2021 - Affinity Tag-based Development and Manufacturing Platform for Non-platform Proteins
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Lingg, N; Fischer, A; Striedner, G; Oostenbrink, C; Schneider, R; Berkemeyer, M; Jungbauer, A
Veranstaltung: 34th International Symposium on Preparative and Process Chromatography, e-PREP 2021
Datum: 07.06.2021 - 09.06.2021 | Ort: Online
Jahr: 2021 - A molecular dynamic study of Soil Organic Matter stabilization mechanisms
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Galicia-Andrés, E; Escalona, Y; Grančič, P; Oostenbrink, C; Tunega, D; Gerzabek, MH
Veranstaltung: European Geosciences Union EGU General Assembly 2021
Datum: 19.04.2021 - 30.04.2021 | Ort: Online
Jahr: 2021 - Intermolecular Interactions between Soil Organic Matter and Clay Minerals
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Galicia-Andrés, E; Escalona, Y; Petrov, D; Oostenbrink, C; Tunega, D; Gerzabek, MH
Veranstaltung: EUROSOIL 2021
Datum: 23.08.2021 - 27.08.2021 | Ort: Online | Ort: Geneva, Switzerland
Jahr: 2020 - GROMOS - programming
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: GROMOS programming Workshop
Datum: 07.09.2020 - 09.09.2020 | Ort: Hernstein, Austria
Jahr: 2020 - Molecular Models of Soil Organic Matter - Simulation meets Experiment
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Institute Seminar at the Institute of Soil, Water and Environmental Sciences, Agricultural Research Organization
Datum: 26.11.2020 | Ort: Rishon LeTsiyon, Israel
Jahr: 2020 - In silico models of Spike-Ace2 interactions
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Meeting - "Structural Biology meets Clinic"
Datum: 02.12.2020 | Ort: Graz, Austria
Jahr: 2020 - Computermodelle von Spike-ACE2-Wechselwirkungen zur Entwicklung von therapeutischen Proteinen
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: WWTF Vortragsreihe "Wien erforscht Corona"
Datum: 15.10.2020 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2019 - Computational alchemy to study interactions of food components, drugs and enzymes
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zürich
Datum: 05.03.2019 | Ort: Zürich, Switzerland
Jahr: 2019 - Interaction between CDH and LPMO
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Breslmayr, E; Laurent, C; Scrutton, N; Oostenbrink, C; Ludwig, R; Kracher, D
Veranstaltung: Gordon Research Conference "Carbohydrate-Active Enzymes for Glycan Conversions"
Datum: 21.07.2019 - 26.07.2019 | Ort: Andover, NH, USA
Jahr: 2019 - In Search of a Structural Pattern in Crazy Sugarsidentification of Conformation Clusters of the Oligosaccharides Within Glycoproteins with LEUS
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Turupcu, A; Oostenbrink, C
Veranstaltung: 63rd Annual Meeting of the Biophysical-Society 2019
Datum: 02.03.2019 - 06.03.2019 | Ort: Baltimore, MD, USA
Jahr: 2019 - Applications of free-energy calculations from molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Europin summerschool on drug design
Datum: 19.09.2019 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2019 - Simulation of Reversible Protein -Protein Binding at an Atomistic Scale
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Perthold, JW; Ohlknecht, C; Petrov, D; Oostenbrink, C
Veranstaltung: Joint 12th EBSA European Biophysics Congress / 10th IUPAP International Conference on Biological Physics (ICBP)
Datum: 20.07.2019 - 24.07.2019 | Ort: Madrid, Spain
Jahr: 2019 - Applications and advances in the one-step perturbation approach
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Alchemical Free Energy Workshop, Univ. Göttingen
Datum: 26.05.2019 | Ort: Göttingen, Germany
Jahr: 2019 - Molecular dynamics simulations of soil organic matter
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Annual Meeting of the Soil Science Society of Switzerland and the German Soil Science Society 2019
Datum: 24.08.2019 - 30.08.2019 | Ort: Bern, Switzerland
Jahr: 2019 - Molecular dynamics simulations of soil condensed phases
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Galicia-Andrés, E; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C
Veranstaltung: 8th International Symposium on Interactions of Soil Minerals with Organic Components and Microorganisms
Datum: 23.06.2019 - 28.06.2019 | Ort: Seville, Spain
Jahr: 2018 - Binding molecules with free-energy calculations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Meeting of the Netherlands Society for Biomolecular Modeling
Datum: 16.11.2018 | Ort: Utrecht, Netherlands
Jahr: 2018 - A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Breslmayr, E., Oostenbrink, C., Ludwig, R.
Veranstaltung: OxiZymes 2018
Datum: 08.07.2018 - 10.07.2018 | Ort: Belfast, Northern Ireland, UK | Veranstalter: QUB
Jahr: 2018 - Use of molecular dynamics in drug discovery
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Boehringer Ingelheim
Datum: 03.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - Binding free energy calculations for allosteric modulators
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: CECAM workshop 'Compallo'
Datum: 10.04.2018 | Ort: Lausanne, Switzerland
Jahr: 2018 - Interaction of organic molecules with reactive soil interfaces – molecular modeling and simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Gerzabek, MH; Tunega, D; Petrov, D; Andres, EG; Grančič, P; Georgieva, I; Aquino, AJA; Lischka, H; Oostenbrink, C
Veranstaltung: 21st World Congress of Soil Science WCSS 2018
Datum: 12.08.2018 - 17.08.2018 | Ort: Rio de Janeiro, Brazil
Jahr: 2018 - Modeling and simulations of post-translational modifications and glycosylated proteins
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Conference 'Two days of proteostasis'
Datum: 11.10.2018 - 12.10.2018 | Ort: Konstanz, Germany
Jahr: 2018 - Microscopic analysis of the structure, dynamics and absorption properties of the standard Leonardite humic acid using molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Petrov, D; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C
Veranstaltung: 21st World Congress of Soil Science WCSS 2018
Datum: 12.08.2018 - 17.08.2018 | Ort: Rio de Janeiro, Brazil
Jahr: 2018 - Influence of force field, environmental changes and post-translational modifications on protein structure and stability
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: CECAM workshop 2018 - Proteins in realistic environments
Datum: 23.05.2018 - 25.05.2018 | Ort: Stuttgart, Germany
Jahr: 2017 - 1. Calculation of binding free energy 2. Prediction of Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Universität of Kopenhagen
Datum: 06.03.2017 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2017 - Reversible guest-host interactions from extensive simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: CeCAM Workshop Challenges across Large-Scale Biomolecular and Polymer Simulations
Datum: 23.02.2017 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2017 - Affinity of protein-ligand and protein-protein interactions from molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: VU University Amsterdam
Datum: 19.06.2017 | Ort: Amsterdam, Netherlands
Jahr: 2017 - Robust free-energy calculations from a small number of simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Bioexcel/Compbiomed Free Energy Workshop
Datum: 31.05.2017 | Ort: London, UK
Jahr: 2017 - Modelling of interactions of polar and nonpolar pollutants with soil minerals and soil organic matter
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Tunega D., Gerzabek M.H., Šolc R., Petrov D., Haberhauer G., Georgieva I., Aquino A.J.A., Oostenbrink C., Lischka H.
Veranstaltung: Jahrestagung der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft 2017
Datum: 02.09.2017 - 07.09.2017 | Ort: Göttingen, Germany
Jahr: 2017 - Rational antibody humanization assisted by molecular dynamics simulations
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Schwaigerlehner, L; Mayrhofer, P; Pechlaner, M; Oostenbrink, C; Kunert, R
Veranstaltung: 9th International Conference on Recombinant Protein Production RPP9 2017
Datum: 23.04.2017 - 25.04.2017 | Ort: Dubrovnik, Croatia
Jahr: 2017 - Enhanced sampling tricks for free energies in drug design and metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: CeCAM Workshop Beyond Kd's
Datum: 06.06.2017 | Ort: Lausanne, Switzerland
Jahr: 2017 - Applied Statistical Thermodynamics 2017: from theory to molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Fundacion de Sciencia y Vida, Santiago de Chile
Datum: 25.11.2017 | Ort: Santiago de Chile, Chile
Jahr: 2017 - Rational antibody humanization assisted by molecular dynamics simulations
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Schwaigerlehner, L; Mayrhofer, P; Pechlaner, M; Oostenbrink, C; Kunert, R
Veranstaltung: 25th ESACT Meeting 2017
Datum: 14.05.2017 - 17.05.2017 | Ort: Lausanne, Switzerland
Jahr: 2017 - Applications of free-energy calculations from molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch.;
Veranstaltung: Drug Design Summerschool, University of Vienna, Vienna, Austria
Datum: 19.09.2017 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2016 - Characterization and Expression of PQQ-dependent Quinohemoprotein Pyranose Dehydrogenases
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Schütz, G; Schmidt, D; Laurent, C; Obinger, C; Oostenbrink, C; Haltrich, D
Veranstaltung: OxiZymes 2016
Datum: 03.07.2016 - 06.07.2016 | Ort: Wageningen, Netherlands
Jahr: 2016 - Alchemical changes from molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: CA' Foscari University of Venice
Datum: 21.10.2016 | Ort: Venice, Italy
Jahr: 2016 - Alchemical changes from molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: GÖCh Seminar
Datum: 17.10.2016 | Ort: Innsbruck, Austria
Jahr: 2016 - Approximating robust free-energy methods using a small number of simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Vertex Free-Energy Workshop, Boston, USA
Datum: 15.05.2016 - 18.05.2016 | Ort: Boston, MA, USA
Jahr: 2016 - Ensembles and sampling, leading to molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: 13th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2016
Datum: 01.09.2016 - 10.09.2016 | Ort: Split, Croatia
Jahr: 2016 - Free-energy calculations for ligand binding: pathways and promiscuity
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: 6th Visegrad Symposium on Structural Systems Biology
Datum: 19.06.2016 - 21.06.2016 | Ort: Warsaw, Poland
Jahr: 2016 - Calculation of free energys from molecular simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: 13th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2016
Datum: 01.09.2016 - 10.09.2016 | Ort: Split, Croatia
Jahr: 2016 - Alchemical changes from molecular dynamics simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Cecam Workshop - Exploring Chemical Space with Machine Learning and Quantum Mechanics
Datum: 30.05.2016 - 03.06.2016 | Ort: Zürich, Switzerland
Jahr: 2016 - Dioxygen evolution by chlorite dismutase depends on co-ordination of transiently produced hypochlorite to an oxoiron(IV) intermediate
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Hofbauer, S., Grünwald-Gruber, C., Schaffner, I., Sündermann, A., Jakopitsch, C., Oostenbrink, C., Djinovic-Carugo, K., Furtmüller, P.G., Obinger, C.
Veranstaltung: 79th Harden Conference on Oxygen Evolution and Reduction
Datum: 16.04.2016 - 20.04.2016 | Ort: Innsbruck, Austria
Jahr: 2015 - Sampling to score in molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: 15th International Conference on BioInformatics and BioEngineering- BIBE 2015
Datum: 02.11.2015 - 03.11.2015 | Ort: Belgrade, Republic of Serbia
Jahr: 2015 - Molecular models and simulations of complex systems: structure, dynamics and interactions
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: TNO Research
Datum: 02.02.2015 | Ort: Zeist, Netherlands
Jahr: 2015 - Biomolecular simulations of Cytochrome P450 enzymes ... and some other proteins
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Mini Symposium VU University Amsterdam 2015
Datum: 02.04.2015 - 03.04.2015 | Ort: Amsterdam, Netherlands
Jahr: 2015 - Course on Applied Statistical Thermodynamics
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Applied Statistical Thermodynamics 2015 - Workshop in Life Sciences Foundation
Datum: 16.11.2015 - 30.11.2015 | Ort: Santiago de Chile, Chile
Jahr: 2015 - Simulations of weird, but defined, and common, but undefined, molecules
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Kings Collage
Datum: 30.04.2015 | Ort: London, UK
Jahr: 2015 - BIOMOLECULAR SIMULATIONS OF CYTOCHROME P450 ENZYMES
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C
Veranstaltung: 19th North American Meeting of the International-Society-for-the-Study-of-Xenobiotics ISSX and 29th Meeting of the Japanese-Society-for-the-Study-of-Xenobiotics JSSX 2015
Datum: 19.10.2014 - 23.10.2014 | Ort: San Francisco, CA, USA
Jahr: 2015 - 1. Calculation of Binding Free Energy, 2. Prediction of Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Workshop University of Copenhagen
Datum: 02.03.2015 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2015 - Protein-ligand binding from distancefield distances and Hamiltonian replica exchange simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, Ch;
Veranstaltung: Cecam Workshop
Datum: 16.09.2015 - 18.09.2015 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2014 - Binding free-energy calculations involving a net charge change
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Workshop on Free Energy Methods in Drug Design
Datum: 17.05.2014 - 21.05.2014 | Ort: Boston, MA, USA
Jahr: 2014 - Binding free energy, enthalpy and entropy – from a toy system to the real thing
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: CeCAM Workshop on Biomolecular Entropy
Datum: 14.05.2014 - 16.05.2014 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2014 - Calculation of free energies from molecular simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014
Datum: 27.09.2014 - 06.10.2014 | Ort: Primosten, Croatia
Jahr: 2014 - Structure refinement using molecular dynamics simulations (NMR observables)
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014
Datum: 27.09.2014 - 06.10.2014 | Ort: Primosten, Croatia
Jahr: 2014 - Calculation of free energy
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Copenhagen University
Datum: 24.02.2014 - 25.02.2014 | Ort: Copenhagen, Denmark | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2014 - Structure and Dynamics of Cytochromes P450 from Molecular Simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Konferenz Deajeong University
Datum: 06.06.2014 - 17.06.2014 | Ort: Seoul, South Korea
Jahr: 2014 - Molecular models and simulations of soil organic matter: structure, dynamics and interactions with other entities
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: International Symposium on: Biogeochemical interfaces in soil – towards a comprehensive and mechanistic understanding of soil functions
Datum: 06.10.2014 - 08.10.2014 | Ort: Leipzig, Germany
Jahr: 2014 - Mechanism of inhibition of chlorite dismutase
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Hofbauer, S., Schaffner, I., Gruber, C., Pirker, K.F., Jakopitsch, C., Sündermann, A., Oostenbrink, C., Furtmüller, P.G., Obinger, C.
Veranstaltung: OxiZymes 2014
Datum: 01.07.2014 - 04.07.2014 | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter: Vienna Institute of Biotechnology (VIBT) of the University of Natural Resources and Life Sciences, Vienna
Jahr: 2014 - Pyranose degydrogenase active-site mutants: simulation vs. experiment
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Graf, M.M.H.; Bren, U.; Sucharitakul, J.; Chaiyen, P.; Oostenbrink, C.; Haltrich, D.
Veranstaltung: 6th ÖGMBT Annual Meeting 2014 - Life Sciences meet Entrepreneurship
Datum: 15.09.2014 - 18.09.2014 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2014 - Biomolecular simulations of Cytochromes P450
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 19th North American meeting of the International Society for the Study of Xenbiotics
Datum: 19.10.2014 - 23.10.2014 | Ort: San Francisco, CA, USA
Jahr: 2014 - Molecular simulation techniques for complex biomolecular systems
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Annual meeting of Biophysics Austria and of the Austrian Society for Molecular Biosciences and Biotechnology (ÖGBMT)
Datum: 15.09.2014 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2014 - Free-energy calculations for ligand binding: pathways and promiscuity
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: MGMS Meeting - Modeling Molecules and Materials
Datum: 20.08.2014 - 22.08.2014 | Ort: Glasgow, Scotland, UK
Jahr: 2014 - Binding free energy, enthalpy and entropy – from a toy system to the real thing
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Workshop Molecular Recognition
Datum: 06.08.2014 - 14.08.2014 | Ort: Telluride, CO, USA
Jahr: 2014 - Ensembles and sampling, leading to molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014
Datum: 27.09.2014 - 06.10.2014 | Ort: Primosten, Croatia
Jahr: 2014 - Molecular simulation techniques for complex soil systems
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 20th World Congress on Soil Science
Datum: 08.06.2014 - 13.06.2014 | Ort: Jeju, South Korea
Jahr: 2014 - Prediction of Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Copenhagen University
Datum: 24.02.2014 - 25.02.2014 | Ort: Copenhagen, Denmark | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2013 - Sampling to score in molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Univ. Darmstadt, D
Datum: 23.01.2013 | Ort: Darmstadt, Germany
Jahr: 2013 - Sampling to score in molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Univ. Basel, CH
Datum: 29.04.2013 - 30.04.2013 | Ort: Basel, Switzerland
Jahr: 2013 - Sampling to score in molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: “Thirty-seven years of biomolecular simulation”, Symposium ETH Zürich, CH
Datum: 17.05.2013 | Ort: Zürich, Switzerland
Jahr: 2013 - Structure refinement by using experimental restraints in molecular dynamics simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Mini Symposium Bio Nano Imaging 2013
Datum: 22.05.2013 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2013 - 1. Calculation of Binding Free Energy 2. Prediction of Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Univ. Copenhagen, DK
Datum: 11.02.2013 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2013 - Humic substances (HS) models – water and cations bridges
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Gerzabek, M.H., Aquino, A.J.A, Haberhauer, G., Solc, R., Pasalic, H., Lischka, H., Oostenbrink, C., Schaumann, G., Tunega, D.
Veranstaltung: IUSS-Global Soil Carbon Conference
Datum: 03.06.2013 - 06.06.2013 | Ort: Madison, WI, USA
Jahr: 2013 - Biomolecular simulations on Cytochrome P450 enzymes
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Univ. Szeged, Ungarn
Datum: 27.03.2013 - 29.03.2013 | Ort: Szeged, Hungary
Jahr: 2013 - Structure and Dynamics of Cytochromes P450 from Molecular Simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Gedeon Richter, Budapest, Ungarn
Datum: 21.10.2013 - 22.10.2013 | Ort: Budapest, Hungary
Jahr: 2013 - Biomolecular simulations to rationalize and predict protein behaviour
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: MolTag Seminar, University of Vienna 2013
Datum: 04.04.2013 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2013 - Calculating free energies from molecular simulations: where sampling and scoring comes together
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK
Datum: 09.07.2013 | Ort: Cambridge, UK
Jahr: 2013 - Sampling and scoring for binding free energy differences
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Workshop - New trends in Computational Chemistry for Industry Applications, Barcelona, Spanien
Datum: 23.05.2013 - 24.05.2013 | Ort: Barcelona, Spain
Jahr: 2012 - 1: Force-field development 2: Calculation of free energy 3: Structure refinement
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 10th NCCR Practical Course 2012 - Biomolecular Modeling
Datum: 09.01.2012 - 13.01.2012 | Ort: Kandersteg, Switzerland
Jahr: 2012 - Biomolecular simulations to rationalize and predict protein behaviour
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Doktoratsseminar Universität Graz 2012
Datum: 30.11.2012 | Ort: Graz, Austria
Jahr: 2012 - Structure and thermodynamics of (bio)molecular complexes from comput-er simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 7th Vienna International Conference on Mathematical Modelling MATHMOD 2012
Datum: 15.02.2012 - 17.02.2012 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2012 - Redox theromdynamics of diverse chlorite dismutases
Art: Poster - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Hofbauer, S. Bellei, M. Sündermann, A. Kostan, J. Daims, H. Djinović-Carugo, K. Oostenbrink, C. Furtmüller, P.G. Battistuzzi, G. & Obinger, C.
Veranstaltung: OxiZymes 2012
Datum: 16.09.2012 - 19.09.2012 | Ort: Marseille, France
Jahr: 2012 - 1: Calculculation of Binding Free Energy 2: Prediction of Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: University of Copenhagen 2012
Datum: 03.02.2012 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2012 - In silico ADME and predictive Toxicology: Metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: SafeSciMET course University of Copenhagen 2012
Datum: 09.05.2012 - 10.05.2012 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2012 - Affiniteit en binding
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Alumni-day of Chemistry at VU University, Amsterdam 2012
Datum: 10.05.2012 - 16.05.2012 | Ort: Amsterdam, Netherlands
Jahr: 2012 - 1: Ensembles and sampling leading to molecular dynamics simulations 2: Structure refinement using molecular dynamics simulations (NMR observables) 3: Calculation of free energy from molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: 11th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2012
Datum: 30.09.2012 - 09.10.2012 | Ort: Primosten, Croatia
Jahr: 2012 - Structure and dynamics of Cytochromes P450 from molecular simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: MDO / ISSX Meeting 2012
Datum: 16.06.2012 - 21.06.2012 | Ort: Noordwijk, Netherlands
Jahr: 2012 - Molecular Modeling and Simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C;
Veranstaltung: Workshop Nanostructured Materials for Biomedical Applications Vienna-Brno-Olomouc 2012
Datum: 16.10.2012 | Ort: Brno, Czech Republic
Jahr: 2011 - Free energy calculations from molecular simulations - where sampling and scoring comes together
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: Mini-Symposium zur Informatikgestützten Chemie 2011
Datum: 20.06.2011 | Ort: Zürich, Switzerland
Jahr: 2011 - Free energy calculations from molecular simulations.
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: Max F. Perutz Laboratories Wien 2011
Datum: 31.03.2011 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2011 - Barriers in binding biomolecular free energy differences
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.
Veranstaltung: SimBioMa Conference 2011
Datum: 28.09.2011 - 01.10.2011 | Ort: Konstanz, Germany
Jahr: 2011 - Structure and flexibility of Cytochrome P40 enzymes from molecular simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.
Veranstaltung: MipTec 2011
Datum: 19.09.2011 - 22.09.2011 | Ort: Basel, Switzerland
Jahr: 2011 - Computational chemistry and advanced physiochemical characterization
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.
Veranstaltung: DFG-SPP 1315 Workshop, TG 5, BOKU, Molecular simulation techniques for complex systems 2011
Datum: 10.01.2011 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2011 - Prediction of metabolism
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: PhD Course University of Copenhagen 2011
Datum: 09.02.2011 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2011 - "Biomolecular Simulation"
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.
Veranstaltung: Short Course and Workshop at Pancasila University 2011
Datum: 28.07.2011 - 30.07.2011 | Ort: Jakarta, Indonesia
Jahr: 2011 - Calculation of Binding Free Energy
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: PhD Course University of Copenhagen 2011
Datum: 09.02.2011 | Ort: Copenhagen, Denmark
Jahr: 2011 - Free energy calculations from molecular simulations
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: Avexxin AS 2011
Datum: 24.06.2011 | Ort: Trondheim, Norway
Jahr: 2011 - Molecular modeling and simulation to explore the structure and dynamics of biomolecular complexes
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Oostenbrink, C.,
Veranstaltung: Seminar The New Challenges of Natural Medicine Development 2011
Datum: 23.07.2011 | Ort: Jakarta, Indonesia
Jahr: 2010 - Modeling and simulation to explore the structure and dynamics of biomolecular complexes.
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris, Oostenbrink
Veranstaltung: Vienna Institute of Bio Technology 2010
Datum: 29.04.2010 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2010 - "Free energy calculations from molecular simulation - where sampling and scoring comes together"
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris Oostenbrink, Dr.
Veranstaltung: Conference Molecular Modeling of the Australasian molecular modeling association Melbourne 2010
Datum: 29.11.2010 | Ort: Melbourne, Australia
Jahr: 2010 - The role of water molecules in docking studies of Cytochrome P450 2D6
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris, Oostenbrink
Veranstaltung: 240th National Fall Meeting of the American Chemical Society ACS 2010
Datum: 23.08.2010 | Ort: Boston, MA, USA
Jahr: 2010 - Free energy calculations for multiple conformations using enhanced sampling techniques.
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris, Oostenbrink
Veranstaltung: Multiscale Molecular Modeling
Datum: 03.07.2010 | Ort: Edinburgh, Scotland, UK
Jahr: 2010 - Structure and (thermo)dynamics of biomolecular complexes from computer simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris Oostenbrink, Dr.
Veranstaltung: Seminar-University of Queensland
Datum: 15.11.2010 | Ort: Brisbane, Australia
Jahr: 2009 - Binding thermodynamics from molecular simulation
Art: Vortrag - Ausgewählte Präsentation
Autoren: Chris Oostenbrink
Veranstaltung: Seminar series 2009 - Computational Life Sciences
Datum: 11.12.2009 | Ort: Vienna, Austria