Chris Oostenbrink

Vorträge

• Jahr: 2024 -  Buffer region neural networks: A buffered scheme for polarizable QM/MM simulations with machine-learning (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch

  Veranstaltung: Virapid Workshop 2024

  Datum: 26.02.2024 - 29.02.2024  | Ort: Vienna, Austria  | Veranstalter: Universität Wien

• Jahr: 2024 -  Free energies and enhanced sampling ofbiomolecular systems by accelerating enveloping distribution sampling (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Doctoral Journal Club 2024

  Datum: 24.06.2024 - 24.06.2024  | Ort: Graz, Graz, Österreich  | Veranstalter: Universität Graz

• Jahr: 2024 -  Free energies and enhanced sampling from accelerated molecular dynamics simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch

  Veranstaltung: 2024 Workshop on Free Energy Methods in Drug Design

  Datum: 13.05.2024 - 15.05.2024  | Ort: Leiden, Niederlande  | Veranstalter: Free Energy Methods in Drug Design

• Jahr: 2024 -  Free energies and enhancedsampling from accelerated molecular dynamics simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Odyssey Therapeutics, Inc. 2024

  Datum: 21.08.2024 - 21.08.2024  | Ort: Wien, Wien, Österreich  | Veranstalter: BOKU University

• Jahr: 2023 -  Domain interactions investigated by SAXS (Poster)

  Autoren: Motycka, B; Csarman, F; Nagy, G; Tscheließnig, R; Oostenbrink, C; Hammel, M; Ludwig, R

  Veranstaltung: BioToP Conference 2023

  Datum: 19.06.2023 - 20.06.2023  | Ort: Wien | Ort: Wien | Ort: Vienna, AUSTRIA  | Veranstalter: University of Natural Resources and Life Sciences | Veranstalter: BioToP - BOKU International PhD programme

• Jahr: 2023 -  Characterization of soil microaggregates at the microscopic level using molecular dynamics (Vortrag)

  Autoren: Galicia-Andrés, E; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: International Conference of European Clay Groups Association 2023

  Datum: 24.07.2023 - 27.07.2023  | Ort: Bari

• Jahr: 2023 -  Molecular dynamics simulations as a tool in protein engineering (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: FEBS Advanced Course on Computational Approaches to Understanding and Engineering Enzyme Catalysis

  Datum: 26.09.2023  | Ort: Zagreb, CROATIA

• Jahr: 2023 -  Predicting free-energy differences from accelerated envelopingdistribution sampling (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Seminar- Instituto de Biosistemas e Ciências Integrativas

  Datum: 16.03.2023  | Ort: Lissabon, PORTUGAL

• Jahr: 2023 -  Applications of free-energy calculations from molecular dynamicssimulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: EUROPIN Summerschool

  Datum: 12.09.2023  | Ort: Vienna, AUSTRIA

• Jahr: 2023 -  Predicting free-energy differences from accelerated enveloping distribution sampling (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Seminar Max F. Perutz Laboratories

  Datum: 29.06.2023  | Ort: Vienna, AUSTRIA

• Jahr: 2023 -  A buffered scheme for polarizableQM/MM simulations with machine-learning (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: SIMPLAIX Workshop on "Machine Learning for Multiscale MolecularModeling",

  Datum: 02.05.2023 - 04.05.2023  | Ort: Heidelberg, DEUTSCHLAND

• Jahr: 2022 -  Hot, Hotter, BuRNN: A new scheme for polarizable QM/MMsimulations with machine-learning (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: ISQBP Meeting

  Datum: 11.07.2022  | Ort: Innsbruck, Austria

• Jahr: 2022 -  Molecular Modeling and Simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Central European Institute of Technology

  Datum: 24.06.2022  | Ort: Brno, CZ

• Jahr: 2022 -  Molecular scale view at organo–mineral aggregates (Vortrag)

  Autoren: Galicia–Andrés, E; Oostenbrink, C; Gerzabek, MH; Tunega, D

  Veranstaltung: 22nd World Congress of Soil Sciences 2022

  Datum: 31.07.2022 - 05.08.2022  | Ort: Glasgow, Scotland, UK

• Jahr: 2022 -  Modelling of soil organic matter and its interactions with clay minerals (Vortrag)

  Autoren: Gerzabek, M.H.; Galicia Andres; E., Escalona, Y.; Grancic, P; Petrov, D.; Tunega, D; Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: Jahrestagung der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft DBG 2022

  Datum: 05.09.2022 - 08.09.2022  | Ort: Trier, Germany

• Jahr: 2021 -  Understanding of adsorption and degradation of halogenated hydrocarbons at mineral surfaces (Vortrag)

  Autoren: de Azevedo Barbosa, A.C.; Tunega, D.; Gerzabek, M.H.; Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: 6. DWB Student Conference 2021 - Forest & Soil Science update

  Datum: 17.05.2021  | Ort: Vienna, Austria | Ort: Online  | Veranstalter: Depertment of Forest and Soil Sciences, BOKU

• Jahr: 2021 -  Intermolecular Interactions between Soil Organic Matter and Clay Minerals (Vortrag)

  Autoren: Galicia-Andrés, E; Escalona, Y; Petrov, D; Oostenbrink, C; Tunega, D; Gerzabek, MH

  Veranstaltung: EUROSOIL 2021

  Datum: 23.08.2021 - 27.08.2021  | Ort: Online | Ort: Geneva, Switzerland

• Jahr: 2021 -  Free energies from molecular simulations: force fields and molecular interactions (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: 5th International Symposium on Bioinformatics

  Datum: 15.12.2021  | Ort: Online

• Jahr: 2021 -  Affinity Tag-based Development and Manufacturing Platform for Non-platform Proteins (Vortrag)

  Autoren: Lingg, N; Fischer, A; Striedner, G; Oostenbrink, C; Schneider, R; Berkemeyer, M; Jungbauer, A

  Veranstaltung: 34th International Symposium on Preparative and Process Chromatography, e-PREP 2021

  Datum: 07.06.2021 - 09.06.2021  | Ort: Online

• Jahr: 2021 -  A molecular dynamic study of Soil Organic Matter stabilization mechanisms (Vortrag)

  Autoren: Galicia-Andrés, E; Escalona, Y; Grančič, P; Oostenbrink, C; Tunega, D; Gerzabek, MH

  Veranstaltung: European Geosciences Union EGU General Assembly 2021

  Datum: 19.04.2021 - 30.04.2021  | Ort: Online

• Jahr: 2020 -  GROMOS - programming (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: GROMOS programming Workshop

  Datum: 07.09.2020 - 09.09.2020  | Ort: Hernstein, Austria

• Jahr: 2020 -  Molecular Models of Soil Organic Matter - Simulation meets Experiment (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Institute Seminar at the Institute of Soil, Water and Environmental Sciences, Agricultural Research Organization

  Datum: 26.11.2020  | Ort: Rishon LeTsiyon, Israel

• Jahr: 2020 -  In silico models of Spike-Ace2 interactions (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Meeting - "Structural Biology meets Clinic"

  Datum: 02.12.2020  | Ort: Graz, Austria

• Jahr: 2020 -  Computermodelle von Spike-ACE2-Wechselwirkungen zur Entwicklung von therapeutischen Proteinen (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: WWTF Vortragsreihe "Wien erforscht Corona"

  Datum: 15.10.2020  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2019 -  Computational alchemy to study interactions of food components, drugs and enzymes (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Institute of Food, Nutrition and Health, ETH Zürich

  Datum: 05.03.2019  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2019 -  Interaction between CDH and LPMO (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Laurent, C; Scrutton, N; Oostenbrink, C; Ludwig, R; Kracher, D

  Veranstaltung: Gordon Research Conference "Carbohydrate-Active Enzymes for Glycan Conversions"

  Datum: 21.07.2019 - 26.07.2019  | Ort: Andover, NH, USA

• Jahr: 2019 -  In Search of a Structural Pattern in Crazy Sugarsidentification of Conformation Clusters of the Oligosaccharides Within Glycoproteins with LEUS (Vortrag)

  Autoren: Turupcu, A; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 63rd Annual Meeting of the Biophysical-Society 2019

  Datum: 02.03.2019 - 06.03.2019  | Ort: Baltimore, MD, USA

• Jahr: 2019 -  Structural modifications to Neurospora crassa LPMO9C and their effect on the catalytic activity (Poster)

  Autoren: Laurent C V F P, Sun P, Cannazza P, Breslmayr E, Scheiblbrandner S, Frommhagen M, van Berkel W J H, Oostenbrink C, Kabel M A, Ludwig

  Veranstaltung: 14th International Symposium on Biocatalysis and Biotransformation BioTrans 2019

  Datum: 07.07.2019 - 11.07.2019  | Ort: Groningen, Netherlands

• Jahr: 2019 -  Applications of free-energy calculations from molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Europin summerschool on drug design

  Datum: 19.09.2019  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2019 -  Molecular dynamics simulations of soil condensed phases (Vortrag)

  Autoren: Galicia-Andrés, E; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 8th International Symposium on Interactions of Soil Minerals with Organic Components and Microorganisms

  Datum: 23.06.2019 - 28.06.2019  | Ort: Seville, Spain

• Jahr: 2019 -  Simulation of Reversible Protein -Protein Binding at an Atomistic Scale (Vortrag)

  Autoren: Perthold, JW; Ohlknecht, C; Petrov, D; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: Joint 12th EBSA European Biophysics Congress / 10th IUPAP International Conference on Biological Physics (ICBP)

  Datum: 20.07.2019 - 24.07.2019  | Ort: Madrid, Spain

• Jahr: 2019 -  Applications and advances in the one-step perturbation approach (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Alchemical Free Energy Workshop, Univ. Göttingen

  Datum: 26.05.2019  | Ort: Göttingen, Germany

• Jahr: 2019 -  Structural Aspects of UDP-N-Acetyl-D-Galactosamine:polypeptide N-Acetylgalactosaminyltransferase from the Snail Biomphalaria glabrata. (Vortrag)

  Autoren: Turupcu, A; Poliak, P; Margreitter, C; Oostenbrink, C; Staudacher, E;

  Veranstaltung: Glyco 25 XXV International Symposium on Glycoconjugates

  Datum: 25.08.2019 - 31.08.2019  | Ort: Milan, Italy

• Jahr: 2019 -  Molecular dynamics simulations of soil organic matter (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Annual Meeting of the Soil Science Society of Switzerland and the German Soil Science Society 2019

  Datum: 24.08.2019 - 30.08.2019  | Ort: Bern, Switzerland

• Jahr: 2018 -  Binding molecules with free-energy calculations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Meeting of the Netherlands Society for Biomolecular Modeling

  Datum: 16.11.2018  | Ort: Utrecht, Netherlands

• Jahr: 2018 -  A fast and sensitive activity assay for lytic polysaccharide monooxygenase (Vortrag)

  Autoren: Breslmayr, E., Oostenbrink, C., Ludwig, R.

  Veranstaltung: OxiZymes 2018

  Datum: 08.07.2018 - 10.07.2018  | Ort: Belfast, Northern Ireland, UK

• Jahr: 2018 -  Use of molecular dynamics in drug discovery (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Boehringer Ingelheim

  Datum: 03.09.2018  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2018 -  Binding free energy calculations for allosteric modulators (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: CECAM workshop 'Compallo'

  Datum: 10.04.2018  | Ort: Lausanne, Switzerland

• Jahr: 2018 -  Interaction of organic molecules with reactive soil interfaces – molecular modeling and simulation (Vortrag)

  Autoren: Gerzabek, MH; Tunega, D; Petrov, D; Andres, EG; Grančič, P; Georgieva, I; Aquino, AJA; Lischka, H; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 21st World Congress of Soil Science WCSS 2018

  Datum: 12.08.2018 - 17.08.2018  | Ort: Rio de Janeiro, Brazil

• Jahr: 2018 -  A fast and sensitive LPMO activity assay (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Hanzek, M; Oostenbrink, C; Ludwig, Roland;

  Veranstaltung: 2nd Symposium on the Chemistry, Biology and Application of Lytic Polysaccharide Monooxygenases

  Datum: 07.11.2018 - 09.11.2018  | Ort: Marseille, France

• Jahr: 2018 -  Insights into the modeling of cello-oligosaccharides and lytic polysaccharide monooxygenase (Vortrag)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 22nd Austrian Carbohydrate Workshop 2018

  Datum: 15.02.2018 - 16.02.2018  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2018 -  Modeling and simulations of post-translational modifications and glycosylated proteins (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Conference 'Two days of proteostasis'

  Datum: 11.10.2018 - 12.10.2018  | Ort: Konstanz, Germany

• Jahr: 2018 -  Microscopic analysis of the structure, dynamics and absorption properties of the standard Leonardite humic acid using molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Petrov, D; Tunega, D; Gerzabek, MH; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 21st World Congress of Soil Science WCSS 2018

  Datum: 12.08.2018 - 17.08.2018  | Ort: Rio de Janeiro, Brazil

• Jahr: 2018 -  Humanization of a mouse antibody and subsequent analysis of expected immunogenicity by molecular dynamics simulations and in-silico T-cell epitope predictions. (Poster)

  Autoren: Mayrhofer, P; Schwaigerlehner, L; Oostenbrink, C; Kunert, R

  Veranstaltung: Antibody Engineering & Therapeutics 2018

  Datum: 09.12.2018 - 13.12.2018  | Ort: San Diego, CA, USA

• Jahr: 2018 -  Influence of force field, environmental changes and post-translational modifications on protein structure and stability (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: CECAM workshop 2018 - Proteins in realistic environments

  Datum: 23.05.2018 - 25.05.2018  | Ort: Stuttgart, Germany

• Jahr: 2017 -  1. Calculation of binding free energy 2. Prediction of Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Universität of Kopenhagen

  Datum: 06.03.2017  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2017 -  Rational antibody humanization assisted by molecular dynamics simulations (Poster)

  Autoren: Schwaigerlehner, L; Pechlaner, M; Mayrhofer, P; Oostenbrink, C; Kunert, R

  Veranstaltung: 25th ESACT Meeting 2017

  Datum: 14.05.2017 - 17.05.2017  | Ort: Lausanne, Switzerland

• Jahr: 2017 -  Reversible guest-host interactions from extensive simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: CeCAM Workshop Challenges across Large-Scale Biomolecular and Polymer Simulations

  Datum: 23.02.2017  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2017 -  Affinity of protein-ligand and protein-protein interactions from molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: VU University Amsterdam

  Datum: 19.06.2017  | Ort: Amsterdam, Netherlands

• Jahr: 2017 -  Robust free-energy calculations from a small number of simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Bioexcel/Compbiomed Free Energy Workshop

  Datum: 31.05.2017  | Ort: London, UK

• Jahr: 2017 -  Modelling of interactions of polar and nonpolar pollutants with soil minerals and soil organic matter (Vortrag)

  Autoren: Tunega D., Gerzabek M.H., Šolc R., Petrov D., Haberhauer G., Georgieva I., Aquino A.J.A., Oostenbrink C., Lischka H.

  Veranstaltung: Jahrestagung der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft 2017

  Datum: 02.09.2017 - 07.09.2017  | Ort: Göttingen, Germany

• Jahr: 2017 -  Rational antibody humanization assisted by molecular dynamics simulations (Poster)

  Autoren: Schwaigerlehner, L; Mayrhofer, P; Pechlaner, M; Oostenbrink, C; Kunert, R

  Veranstaltung: 9th International Conference on Recombinant Protein Production RPP9 2017

  Datum: 23.04.2017 - 25.04.2017  | Ort: Dubrovnik, Croatia

• Jahr: 2017 -  Lytic Polysaccharide Monooxygenase Assay (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Oostenbrink, C; Ludwig, R

  Veranstaltung: Gordon Research Conference 2017 - Cellulases and Other Carbohydrate-Active Enzymes

  Datum: 22.07.2017 - 28.07.2017  | Ort: Andover, NH, USA | Ort: Andover, NH, USA

• Jahr: 2017 -  Enhanced sampling tricks for free energies in drug design and metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: CeCAM Workshop Beyond Kd's

  Datum: 06.06.2017  | Ort: Lausanne, Switzerland

• Jahr: 2017 -  Rational antibody humanization assisted by molecular dynamics simulations (Poster)

  Autoren: Schwaigerlehner, L; Mayrhofer, P; Pechlaner, M; Oostenbrink, C; Kunert, R

  Veranstaltung: 25th ESACT Meeting 2017

  Datum: 14.05.2017 - 17.05.2017  | Ort: Lausanne, Switzerland

• Jahr: 2017 -  Applied Statistical Thermodynamics 2017: from theory to molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Fundacion de Sciencia y Vida, Santiago de Chile

  Datum: 25.11.2017  | Ort: Santiago de Chile, Chile

• Jahr: 2017 -  Active site investigation of lytic polysaccharide monooxygenase (Vortrag)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 27th International BIOMOS Symposium on Biomolecular Simulation 2017

  Datum: 13.09.2017 - 15.09.2017  | Ort: Ausserberg, Switzerland

• Jahr: 2017 -  Importance of Copper Charge on the Substrate Specificity of Lytic Polysaccharide Monooxygenase (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: Carbohydrate Bioengineering Meeting 2017

  Datum: 23.04.2017 - 26.04.2017  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2017 -  Applications of free-energy calculations from molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch.;

  Veranstaltung: Drug Design Summerschool, University of Vienna, Vienna, Austria

  Datum: 19.09.2017  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2016 -  Characterization and Expression of PQQ-dependent Quinohemoprotein Pyranose Dehydrogenases (Vortrag)

  Autoren: Schütz, G; Schmidt, D; Laurent, C; Obinger, C; Oostenbrink, C; Haltrich, D

  Veranstaltung: OxiZymes 2016

  Datum: 03.07.2016 - 06.07.2016  | Ort: Wageningen, Netherlands

• Jahr: 2016 -  Computational investigation of substrate specificity of lytic polysaccharide monooxygenase (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 1st LPMO Symposium

  Datum: 15.11.2016 - 17.11.2016  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2016 -  Computational investigation of substrate specificity of lytic polysaccharide monooxygenase (Vortrag)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 26th Intl. BIOMOS Symposium

  Datum: 14.09.2016 - 16.09.2016  | Ort: Ausserberg, Switzerland

• Jahr: 2016 -  Alchemical changes from molecular dynamics simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: CA' Foscari University of Venice

  Datum: 21.10.2016  | Ort: Venice, Italy

• Jahr: 2016 -  Alchemical changes from molecular dynamics simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: GÖCh Seminar

  Datum: 17.10.2016  | Ort: Innsbruck, Austria

• Jahr: 2016 -  Approximating robust free-energy methods using a small number of simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Vertex Free-Energy Workshop, Boston, USA

  Datum: 15.05.2016 - 18.05.2016  | Ort: Boston, MA, USA

• Jahr: 2016 -  Ensembles and sampling, leading to molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: 13th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2016

  Datum: 01.09.2016 - 10.09.2016  | Ort: Split, Croatia

• Jahr: 2016 -  Free-energy calculations for ligand binding: pathways and promiscuity (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: 6th Visegrad Symposium on Structural Systems Biology

  Datum: 19.06.2016 - 21.06.2016  | Ort: Warsaw, Poland

• Jahr: 2016 -  Computational investigation of substrate specificity of lytic polysaccharide monooxygenase (Poster)

  Autoren: Breslmayr, E; Ludwig, R; Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 8th ÖGMBT Annual Meeting 2016

  Datum: 12.09.2016 - 14.09.2016  | Ort: Graz, Austria

• Jahr: 2016 -  Calculation of free energys from molecular simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: 13th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2016

  Datum: 01.09.2016 - 10.09.2016  | Ort: Split, Croatia

• Jahr: 2016 -  Alchemical changes from molecular dynamics simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Cecam Workshop - Exploring Chemical Space with Machine Learning and Quantum Mechanics

  Datum: 30.05.2016 - 03.06.2016  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2016 -  Dioxygen evolution by chlorite dismutase depends on co-ordination of transiently produced hypochlorite to an oxoiron(IV) intermediate (Vortrag)

  Autoren: Hofbauer, S., Grünwald-Gruber, C., Schaffner, I., Sündermann, A., Jakopitsch, C., Oostenbrink, C., Djinovic-Carugo, K., Furtmüller, P.G., Obinger, C.

  Veranstaltung: 79th Harden Conference on Oxygen Evolution and Reduction

  Datum: 16.04.2016 - 20.04.2016  | Ort: Innsbruck, Austria

• Jahr: 2015 -  Sampling to score in molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: 15th International Conference on BioInformatics and BioEngineering- BIBE 2015

  Datum: 02.11.2015 - 03.11.2015  | Ort: Belgrade, Republic of Serbia

• Jahr: 2015 -  Molecular models and simulations of complex systems: structure, dynamics and interactions (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: TNO Research

  Datum: 02.02.2015  | Ort: Zeist, Netherlands

• Jahr: 2015 -  Biomolecular simulations of Cytochrome P450 enzymes ... and some other proteins (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Mini Symposium VU University Amsterdam 2015

  Datum: 02.04.2015 - 03.04.2015  | Ort: Amsterdam, Netherlands

• Jahr: 2015 -  Course on Applied Statistical Thermodynamics (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Applied Statistical Thermodynamics 2015 - Workshop in Life Sciences Foundation

  Datum: 16.11.2015 - 30.11.2015  | Ort: Santiago de Chile, Chile

• Jahr: 2015 -  Simulations of weird, but defined, and common, but undefined, molecules (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Kings Collage

  Datum: 30.04.2015  | Ort: London, UK

• Jahr: 2015 -  BIOMOLECULAR SIMULATIONS OF CYTOCHROME P450 ENZYMES (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C

  Veranstaltung: 19th North American Meeting of the International-Society-for-the-Study-of-Xenobiotics ISSX and 29th Meeting of the Japanese-Society-for-the-Study-of-Xenobiotics JSSX 2015

  Datum: 19.10.2014 - 23.10.2014  | Ort: San Francisco, CA, USA

• Jahr: 2015 -  1. Calculation of Binding Free Energy, 2. Prediction of Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Workshop University of Copenhagen

  Datum: 02.03.2015  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2015 -  Protein-ligand binding from distancefield distances and Hamiltonian replica exchange simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, Ch;

  Veranstaltung: Cecam Workshop

  Datum: 16.09.2015 - 18.09.2015  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Binding free-energy calculations involving a net charge change (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Workshop on Free Energy Methods in Drug Design

  Datum: 17.05.2014 - 21.05.2014  | Ort: Boston, MA, USA

• Jahr: 2014 -  Binding free energy, enthalpy and entropy – from a toy system to the real thing (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: CeCAM Workshop on Biomolecular Entropy

  Datum: 14.05.2014 - 16.05.2014  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Structure-dynamics-function relationships in pyranose dehydroganse (Vortrag)

  Autoren: Graf, M., Bren, U., Sucharitakul, J., Chaiyen, P., Oostenbrink, C., Haltrich, D.

  Veranstaltung: 18th International Symposium on Flavins and Flavoproteins 2014

  Datum: 27.07.2014 - 01.08.2014  | Ort: Bangkok, Thailand | Ort: Cha'Am, Thailand

• Jahr: 2014 -  Characterization of UDP-Sulfoquinovose Synthase from Sulfolobus acidocaldarius (Poster)

  Autoren: Messner, P; Gasselhuber, B; Windwarder, M; Zayni, S; Hofinger, A; Oostenbrink, C; Obinger, C; Kosma, P; Schäffer, C; Zolghadr, B

  Veranstaltung: FASEB Science Research Conference on Microbial Glycobiology

  Datum: 08.06.2014 - 13.06.2014  | Ort: Itasca, IL, USA

• Jahr: 2014 -  Calculation of free energies from molecular simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014

  Datum: 28.09.2014 - 02.10.2014  | Ort: Primosten, Croatia | Ort: Primosten, Croatia

• Jahr: 2014 -  Structure refinement using molecular dynamics simulations (NMR observables) (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014

  Datum: 28.09.2014 - 02.10.2014  | Ort: Primosten, Croatia | Ort: Primosten, Croatia

• Jahr: 2014 -  Calculation of free energy (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Copenhagen University

  Datum: 24.02.2014 - 25.02.2014  | Ort: Copenhagen, Denmark | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2014 -  Structure and Dynamics of Cytochromes P450 from Molecular Simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Konferenz Deajeong University

  Datum: 06.06.2014 - 17.06.2014  | Ort: Seoul, South Korea

• Jahr: 2014 -  Molecular models and simulations of soil organic matter: structure, dynamics and interactions with other entities (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: International Symposium on: Biogeochemical interfaces in soil – towards a comprehensive and mechanistic understanding of soil functions

  Datum: 06.10.2014 - 08.10.2014  | Ort: Leipzig, Germany

• Jahr: 2014 -  Design of a novel type of enzymatic control in NColE7-based zinc finger nucleases (Vortrag)

  Autoren: Nemeth, E; Oostenbrink, C; Gyurcsik, B

  Veranstaltung: 12th European Biological Inorganic Chemistry Conference EuroBIC 2014

  Datum: 24.08.2014 - 28.08.2014  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2014 -  Understanding the inhibition mechanism of chlorite dismutase from the nitrite-oxidizing bacterium Candidatus Nitrospira defluvii (Vortrag)

  Autoren: Hofbauer, S; Gruber, C; Schaffner, I; Pirker, KF; Jakopitsch, C; Sundermann, A; Oostenbrink, C; Furtmuller, PG; Obinger, C

  Veranstaltung: 12th European Biological Inorganic Chemistry Conference EuroBIC 2014

  Datum: 24.08.2014 - 28.08.2014  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2014 -  Mechanism of inhibition of chlorite dismutase (Vortrag)

  Autoren: Hofbauer, S., Schaffner, I., Gruber, C., Pirker, K.F., Jakopitsch, C., Sündermann, A., Oostenbrink, C., Furtmüller, P.G., Obinger, C.

  Veranstaltung: OxiZymes 2014

  Datum: 01.07.2014 - 04.07.2014  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Pyranose degydrogenase active-site mutants: simulation vs. experiment (Poster)

  Autoren: Graf, M.M.H.; Bren, U.; Sucharitakul, J.; Chaiyen, P.; Oostenbrink, C.; Haltrich, D.

  Veranstaltung: 6th ÖGMBT Annual Meeting 2014 - Life Sciences meet Entrepreneurship

  Datum: 15.09.2014 - 18.09.2014  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Biomolecular simulations of Cytochromes P450 (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 19th North American meeting of the International Society for the Study of Xenbiotics

  Datum: 19.10.2014 - 23.10.2014  | Ort: San Francisco, CA, USA

• Jahr: 2014 -  Molecular simulation techniques for complex biomolecular systems (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Annual meeting of Biophysics Austria and of the Austrian Society for Molecular Biosciences and Biotechnology (ÖGBMT)

  Datum: 15.09.2014  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Free-energy calculations for ligand binding: pathways and promiscuity (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: MGMS Meeting - Modeling Molecules and Materials

  Datum: 20.08.2014 - 22.08.2014  | Ort: Glasgow, Scotland, UK

• Jahr: 2014 -  Binding free energy, enthalpy and entropy – from a toy system to the real thing (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Workshop Molecular Recognition

  Datum: 06.08.2014 - 14.08.2014  | Ort: Telluride, CO, USA

• Jahr: 2014 -  Ensembles and sampling, leading to molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 12th Greta Pifat-Mrzljak International School of Biophysics 2014

  Datum: 28.09.2014 - 02.10.2014  | Ort: Primosten, Croatia | Ort: Primosten, Croatia

• Jahr: 2014 -  Active site residues in pyranose dehydrogenase: Biochemical, biophysical, and computational investigation (Vortrag)

  Autoren: Graf, M., Bren, U., Sucharitakul, J., Chaiyen, P., Oostenbrink, C., Haltrich, D.

  Veranstaltung: OxiZymes 2014

  Datum: 01.07.2014 - 04.07.2014  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2014 -  Molecular simulation techniques for complex soil systems (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 20th World Congress on Soil Science

  Datum: 08.06.2014 - 13.06.2014  | Ort: Jeju, South Korea

• Jahr: 2014 -  Prediction of Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Copenhagen University

  Datum: 24.02.2014 - 25.02.2014  | Ort: Copenhagen, Denmark | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2013 -  Sampling to score in molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Univ. Darmstadt, D

  Datum: 23.01.2013  | Ort: Darmstadt, Germany

• Jahr: 2013 -  Sampling to score in molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Univ. Basel, CH

  Datum: 29.04.2013 - 30.04.2013  | Ort: Basel, Switzerland

• Jahr: 2013 -  Sampling to score in molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: “Thirty-seven years of biomolecular simulation”, Symposium ETH Zürich, CH

  Datum: 17.05.2013  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2013 -  Structure refinement by using experimental restraints in molecular dynamics simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Mini Symposium Bio Nano Imaging 2013

  Datum: 22.05.2013  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2013 -  1. Calculation of Binding Free Energy 2. Prediction of Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Univ. Copenhagen, DK

  Datum: 11.02.2013  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2013 -  Humic substances (HS) models – water and cations bridges (Vortrag)

  Autoren: Gerzabek, M.H., Aquino, A.J.A, Haberhauer, G., Solc, R., Pasalic, H., Lischka, H., Oostenbrink, C., Schaumann, G., Tunega, D.

  Veranstaltung: IUSS-Global Soil Carbon Conference

  Datum: 03.06.2013 - 06.06.2013  | Ort: Madison, WI, USA

• Jahr: 2013 -  Biomolecular simulations on Cytochrome P450 enzymes (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Univ. Szeged, Ungarn

  Datum: 27.03.2013 - 29.03.2013  | Ort: Szeged, Hungary

• Jahr: 2013 -  Structure and Dynamics of Cytochromes P450 from Molecular Simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Gedeon Richter, Budapest, Ungarn

  Datum: 21.10.2013 - 22.10.2013  | Ort: Budapest, Hungary

• Jahr: 2013 -  Synthetic glycophospholipids targeting TLR4 mediated immune signaling (Vortrag)

  Autoren: Zamyatina, A.; Beyaert, R.; Kosma, P.; Hollaus, R.; Adanitsch, F.; Artner, D.; Ittig, S.; Jerala, R.; Oostenbrink, C.; Hofbauer, K.

  Veranstaltung: 17th European Carbohydrate Symposium 2013

  Datum: 07.07.2013 - 11.07.2013  | Ort: Tel Aviv, Israel

• Jahr: 2013 -  Biomolecular simulations to rationalize and predict protein behaviour (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: MolTag Seminar, University of Vienna 2013

  Datum: 04.04.2013  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2013 -  Calculating free energies from molecular simulations: where sampling and scoring comes together (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: European Bioinformatics Institute, Cambridge, UK

  Datum: 09.07.2013  | Ort: Cambridge, UK

• Jahr: 2013 -  Sampling and scoring for binding free energy differences (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Workshop - New trends in Computational Chemistry for Industry Applications, Barcelona, Spanien

  Datum: 23.05.2013 - 24.05.2013  | Ort: Barcelona, Spain

• Jahr: 2012 -  1: Force-field development 2: Calculation of free energy 3: Structure refinement (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 10th NCCR Practical Course 2012 - Biomolecular Modeling

  Datum: 09.01.2012 - 13.01.2012  | Ort: Kandersteg, Switzerland

• Jahr: 2012 -  Biomolecular simulations to rationalize and predict protein behaviour (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Doktoratsseminar Universität Graz 2012

  Datum: 30.11.2012  | Ort: Graz, Austria

• Jahr: 2012 -  Structure and thermodynamics of (bio)molecular complexes from comput-er simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 7th Vienna International Conference on Mathematical Modelling MATHMOD 2012

  Datum: 15.02.2012 - 17.02.2012  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2012 -  Redox theromdynamics of diverse chlorite dismutases (Poster)

  Autoren: Hofbauer, S. Bellei, M. Sündermann, A. Kostan, J. Daims, H. Djinović-Carugo, K. Oostenbrink, C. Furtmüller, P.G. Battistuzzi, G. & Obinger, C.

  Veranstaltung: OxiZymes 2012

  Datum: 16.09.2012 - 19.09.2012  | Ort: Marseille, France

• Jahr: 2012 -  1: Calculculation of Binding Free Energy 2: Prediction of Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: University of Copenhagen 2012

  Datum: 03.02.2012  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2012 -  In silico ADME and predictive Toxicology: Metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: SafeSciMET course University of Copenhagen 2012

  Datum: 09.05.2012 - 10.05.2012  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2012 -  Affiniteit en binding (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Alumni-day of Chemistry at VU University, Amsterdam 2012

  Datum: 10.05.2012 - 16.05.2012  | Ort: Amsterdam, Netherlands

• Jahr: 2012 -  1: Ensembles and sampling leading to molecular dynamics simulations 2: Structure refinement using molecular dynamics simulations (NMR observables) 3: Calculation of free energy from molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: 11th Greta Pifat Mrzljak International School of Biophysics 2012

  Datum: 30.09.2012 - 09.10.2012  | Ort: Primosten, Croatia

• Jahr: 2012 -  Pyranose Dehydrogenase - Investigating D-Glucose Binding by Means of Molecular Dynamics Simulation (Poster)

  Autoren: Graf, MM; Bren, U; Peterbauer, C; Oostenbrink, C; Haltrich, D

  Veranstaltung: Trends in Enzymology 2012

  Datum: 03.06.2012 - 06.06.2012  | Ort: Göttingen, Germany

• Jahr: 2012 -  Tools enhancing biomolecular simulations - Cluster Installer & GPU Computation (Poster)

  Autoren: Sündermann, A;

  Veranstaltung: Vienna Scientific Cluster VSC User Workshop 2012

  Datum: 27.02.2012 - 28.02.2012  | Ort: Neusiedl am See, Austria

• Jahr: 2012 -  Structure and dynamics of Cytochromes P450 from molecular simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: MDO / ISSX Meeting 2012

  Datum: 16.06.2012 - 21.06.2012  | Ort: Noordwijk, Netherlands

• Jahr: 2012 -  Molecular Modeling and Simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C;

  Veranstaltung: Workshop Nanostructured Materials for Biomedical Applications Vienna-Brno-Olomouc 2012

  Datum: 16.10.2012  | Ort: Brno, Czech Republic

• Jahr: 2011 -  Free energy calculations from molecular simulations - where sampling and scoring comes together (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: Mini-Symposium zur Informatikgestützten Chemie 2011

  Datum: 20.06.2011  | Ort: Zürich, Switzerland

• Jahr: 2011 -  Free energy calculations from molecular simulations. (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: Max F. Perutz Laboratories Wien 2011

  Datum: 31.03.2011  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2011 -  Barriers in binding biomolecular free energy differences (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: SimBioMa Conference 2011

  Datum: 28.09.2011 - 01.10.2011  | Ort: Konstanz, Germany

• Jahr: 2011 -  Structure and flexibility of Cytochrome P40 enzymes from molecular simulation (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: MipTec 2011

  Datum: 19.09.2011 - 22.09.2011  | Ort: Basel, Switzerland

• Jahr: 2011 -  Computational chemistry and advanced physiochemical characterization (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: DFG-SPP 1315 Workshop, TG 5, BOKU, Molecular simulation techniques for complex systems 2011

  Datum: 10.01.2011  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2011 -  Prediction of metabolism (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: PhD Course University of Copenhagen 2011

  Datum: 09.02.2011  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2011 -  "Biomolecular Simulation" (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.

  Veranstaltung: Short Course and Workshop at Pancasila University 2011

  Datum: 28.07.2011 - 30.07.2011  | Ort: Jakarta, Indonesia

• Jahr: 2011 -  Calculation of Binding Free Energy (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: PhD Course University of Copenhagen 2011

  Datum: 09.02.2011  | Ort: Copenhagen, Denmark

• Jahr: 2011 -  Free energy calculations from molecular simulations (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: Avexxin AS 2011

  Datum: 24.06.2011  | Ort: Trondheim, Norway

• Jahr: 2011 -  Insights into the binding mode of propafenone type P-glycoprotein inhibitors (Vortrag)

  Autoren: Klepsch, F; Vosmeer, CR; Geerke, DP; Oostenbrink, C; Ecker, GF

  Veranstaltung: 241st National Spring Meeting of the American Chemical Society ACS ACS 2011 - Chemistry of Natural Resources

  Datum: 27.03.2011 - 31.03.2011  | Ort: Anaheim, CA, USA

• Jahr: 2011 -  Molecular modeling and simulation to explore the structure and dynamics of biomolecular complexes (Vortrag)

  Autoren: Oostenbrink, C.,

  Veranstaltung: Seminar The New Challenges of Natural Medicine Development 2011

  Datum: 23.07.2011  | Ort: Jakarta, Indonesia

• Jahr: 2010 -  Modeling and simulation to explore the structure and dynamics of biomolecular complexes. (Vortrag)

  Autoren: Chris, Oostenbrink

  Veranstaltung: Vienna Institute of Bio Technology 2010

  Datum: 29.04.2010  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2010 -  "Free energy calculations from molecular simulation - where sampling and scoring comes together" (Vortrag)

  Autoren: Chris Oostenbrink, Dr.

  Veranstaltung: Conference Molecular Modeling of the Australasian molecular modeling association Melbourne 2010

  Datum: 29.11.2010  | Ort: Melbourne, Australia

• Jahr: 2010 -  The role of water molecules in docking studies of Cytochrome P450 2D6 (Vortrag)

  Autoren: Chris, Oostenbrink

  Veranstaltung: 240th National Fall Meeting of the American Chemical Society ACS 2010

  Datum: 23.08.2010  | Ort: Boston, MA, USA

• Jahr: 2010 -  Free energy calculations for multiple conformations using enhanced sampling techniques. (Vortrag)

  Autoren: Chris, Oostenbrink

  Veranstaltung: Multiscale Molecular Modeling

  Datum: 03.07.2010  | Ort: Edinburgh, Scotland, UK

• Jahr: 2010 -  Structure and (thermo)dynamics of biomolecular complexes from computer simulation. (Vortrag)

  Autoren: Chris, Oostenbrink

  Veranstaltung: Opening-Symposium BOKU/AIT 2010 - BioNanoSciences

  Datum: 13.09.2010 - 14.09.2010  | Ort: Vienna, Austria

• Jahr: 2010 -  Structure and (thermo)dynamics of biomolecular complexes from computer simulation (Vortrag)

  Autoren: Chris Oostenbrink, Dr.

  Veranstaltung: Seminar-University of Queensland

  Datum: 15.11.2010  | Ort: Brisbane, Australia

• Jahr: 2009 -  Binding thermodynamics from molecular simulation (Vortrag)

  Autoren: Chris Oostenbrink

  Veranstaltung: Seminar series 2009 - Computational Life Sciences

  Datum: 11.12.2009  | Ort: Vienna, Austria