Heinz Himmelbauer
Univ.Prof. Mag.Dr.rer.nat. Heinz Himmelbauer
Computergestützte Biologie
Standort Muthgasse 18, 1190 Wien
Email heinz.himmelbauer@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-79155
ORCID: 0000-0001-8897-2928, öffnet in neuem Fenster.
AuthorId : 35242348600
Laufbahn
- 2019 Institutsleiter, Institut für Computergestützte Biologie (ICB), Department für Biotechnologie (DBT), BOKU Wien
- 2015 Professur für Bioinformatik, Department für Biotechnologie (DBT), BOKU Wien
- 2008 - 2015 Unit Head, Centre for Genomic Regulation (CRG), Barcelona, Spanien, 2008-2012 Ultrasequencing Unit, 2012-2015 Genomics Unit
- 1995 - 2015 Arbeitsgruppenleiter, Max-Planck-Institut für molekulare Genetik, Berlin-Dahlem, Deutschland, ab 2008 Gastgruppe
- 1993 - 1995 Postdoc, Institut für Molekulare Pathologie (IMP), Wien, Österreich
- 1991 - 1993 Postdoc, Princeton University, Princeton, NJ, USA
- 1987 - 1991 Diplomand, Doktorand, Imperial Cancer Research Fund (ICRF), London, GB
- 1983 - 1991 Studium Universität Salzburg, Österreich, 1988 Diplom, 1991 Doktorat
Projekte
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Publikationen
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Wissentransfer in die Gesellschaft
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Medienbeiträge
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Vorträge
Jahr: 2024 - Insights into RNAse-based self- incompatibility system in Beta vulgaris (Vortrag)
Autoren: Yardeni, G; Holzweber, T; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: XX International Botanical Congress 2024
Datum: 21.07.2024 - 27.07.2024 | Ort: IFEMA MADRID | Veranstalter:
The Spanish Botanical SocietyJahr: 2024 - Machine learning approaches for the analysis of genomic variants in plants (Poster)
Autoren: Sandell, F; Nguyen-Hoang, A; Himmelbauer, H; Dohm, J
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2024
Datum: 30.09.2024 - 02.10.2024 | Ort: Bielefeld, Deutschland | Veranstalter:
DECHEMA Gesellschaft für Chemische Technik und Biotechnologie e.V.Jahr: 2024 - Genomic analysis of wild and cultivated beets (Vortrag)
Autoren: Sandell, F; Himmelbauer, H; Dohm, J
Veranstaltung: 79th IIRB Congress 2024 'Innovation: our driver for a profitable and ecologically balanced sugar beet production'
Datum: 27.02.2024 - 28.02.2024 | Ort: Brüssel, Brüssel, Belgien | Veranstalter:
International Institute of Sugar Beet ResearchJahr: 2024 - Methylation analysis based on a plant-specific deep learning model (Poster)
Autoren: Holzweber, T; Dorn, K; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2024
Datum: 30.09.2024 - 02.10.2024 | Ort: Bielefeld, Deutschland | Veranstalter:
DECHEMA Gesellschaft für Chemische Technik und Biotechnologie e.V.Jahr: 2024 - Genomic insights into climatic adaptation of peach (Prunus persica) (Lecture)
Autoren: Adhikari,K; Grossfurthner, L P; Sandell, F L; Dohm, J C; Himmelbauer, H
Veranstaltung: CPSC conference: Translational agriculture - from model plants to crops
Datum: 21.08.2024 - 23.08.2024 | Ort: Copenhagen, Denmark | Veranstalter:
Copenhagen Plant Science Center (CPSC)Jahr: 2024 - Towards characterization of the genetic self-incompatibility system in Beta vulgaris (Lecture)
Autoren: Yardeni, G; Holzweber, T; Dohm, J C; Himmelbauer, H
Veranstaltung: 10th International Botanical Congress
Datum: 21.07.2024 - 27.07.2024 | Ort: Madrid, Spain | Veranstalter:
Spanische Botanische GesellschaftJahr: 2024 - Towards characterization of the genetic self-incompatibility system in Beta vulgaris (Lecture)
Autoren: Yardeni, G
Veranstaltung: EvolVienna meeting January 2024
Datum: 31.01.2024 - 31.01.2024 | Ort: Wien, Wien, Österreich | Veranstalter:
Gregor Mendel Institut für Molekulare PflanzenbiologieJahr: 2024 - Exploiting k-mers for genotype-phenotype association in spinach (Poster)
Autoren: Schönmann, L
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2024
Datum: 30.09.2024 - 02.10.2024 | Ort: Bielefeld, Deutschland | Veranstalter:
DECHEMA Gesellschaft für Chemische Technik und Biotechnologie e.V.Jahr: 2023 - Back to the roots: Phylogeny of wild and cultivated beets (Vortrag)
Autoren: Wascher, FL; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: 31st Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology / 22nd European Conference on Computational Biology
Datum: 23.07.2023 - 27.07.2023 | Ort: Lyon, FRANCE
Jahr: 2022 - K-mer based phylogeny of wild and cultivated beets (Poster)
Autoren: Wascher, FL; Nancy Stralis-Pavese, N; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: 200 years Gregor Mendel: of peas, cows and people 2022
Datum: 11.03.2022 | Ort: Vienna, AUSTRIA | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2022 - Long-read assemblies of sugar beet and sea beet (Poster)
Autoren: Holzweber T; Dohm, JC; Gruber KR; Himmelbauer H
Veranstaltung: 2nd Beet Resources Conference 2022
Datum: 06.10.2022 - 07.10.2022 | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter:
BOKU ViennaJahr: 2022 - Haplotype divergence of flowering time regulator genes in sugar beet and wild beets (Vortrag)
Autoren: Schönmann, L; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: 2nd Beet Resources Conference 2022
Datum: 06.10.2022 - 07.10.2022 | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter:
BOKU ViennaJahr: 2022 - What we can learn from Beta re-sequencing data (Vortrag)
Autoren: Wascher, FL; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: 2nd Beet Resources Conference 2022
Datum: 06.10.2022 - 07.10.2022 | Ort: Vienna, Austria | Veranstalter:
BOKU ViennaJahr: 2022 - Evolutionary dynamics of the repeat landscape in sugar beet and its wild relatives (Poster)
Autoren: Blazek, L; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: 200 years Gregor Mendel: of peas, cows and people 2022
Datum: 11.03.2022 | Ort: Vienna, AUSTRIA | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2022 - Genetic diversity in Amaranthaceae crops (Poster)
Autoren: Wascher, FL; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: 21st European Conference on Computational Biology ECCB 2022
Datum: 18.09.2022 - 21.09.2022 | Ort: Sitges, Spain
Jahr: 2021 - Analysis of sugar beet and wild beet genomes to study relationships, origins, population dynamics and selection (Poster)
Autoren: Felkel, S; Stralis-Pavese, N; Schulz, B; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2021
Datum: 06.09.2021 - 09.09.2021 | Ort: Online
Jahr: 2021 - Comparison of wild and cultivated beets regarding repeats and transposon insertion polymorphisms (Poster)
Autoren: Blazek, L; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2021
Datum: 06.09.2021 - 09.09.2021 | Ort: Online
Jahr: 2021 - K-mer-based phylogeny of wild and cultivated beets (Poster)
Autoren: Wascher, F; Stralis-Pavese, N; Schulz, B; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2021
Datum: 06.09.2021 - 09.09.2021 | Ort: Online
Jahr: 2020 - Quinoa sequencing and detection of haplotype blocks for genome scaffolding (Poster)
Autoren: Himmelbauer, H; Bodrug, A; Wascher, FL; Stralis-Pavese, N; Bürstmayr, H; Dohm, JC
Veranstaltung: "Digital Breeding". Internationales Symposium der Gesellschaft für Pflanzenzüchtung e.V. (GPZ) 2020
Datum: 11.02.2020 - 13.02.2020 | Ort: Tulln an der Donau, Austria | Veranstalter:
Gesellschaft für PflanzenzüchtungJahr: 2020 - Evolutionary dynamics of the repeat landscape in sugar beet and its wild relatives (Poster)
Autoren: Blazek, B; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: "Digital Breeding". Internationales Symposium der Gesellschaft für Pflanzenzüchtung e.V. (GPZ) 2020
Datum: 11.02.2020 - 13.02.2020 | Ort: Tulln an der Donau, Austria | Veranstalter:
Gesellschaft für PflanzenzüchtungJahr: 2020 - Population analysis of sugar beet and wild beets (Poster)
Autoren: Wascher, FL; Felkel, S; Stralis-Pavese, N; Schulz, B; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: "Digital Breeding". Internationales Symposium der Gesellschaft für Pflanzenzüchtung e.V. (GPZ) 2020
Datum: 11.02.2020 - 13.02.2020 | Ort: Tulln an der Donau, Austria | Veranstalter:
Gesellschaft für PflanzenzüchtungJahr: 2020 - Analysis of subgenome structure and evolution in allopolyploid plants (Vortrag)
Autoren: Schiavinato, M; Bodrug, A; Marcet-Houben, M; Gabaldón, T; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: "Digital Breeding". Internationales Symposium der Gesellschaft für Pflanzenzüchtung e.V. (GPZ) 2020
Datum: 11.02.2020 - 13.02.2020 | Ort: Tulln an der Donau, Austria | Veranstalter:
Gesellschaft für PflanzenzüchtungJahr: 2019 - Plant Speed Dating (Vortrag)
Autoren: Schiavinato, M; Marcet-Houben, M; Dohm, JC; Gabaldón, T; Himmelbauer, H
Veranstaltung: 12th European Conference on Python in Science
Datum: 02.09.2019 - 06.09.2019 | Ort: Bilbao, Spain
Jahr: 2018 - Detection of haplotype blocks for genome scaffolding in plants (Poster)
Autoren: Bodrug, A; Bürstmayr, H; Stralis Pavese, N; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2018
Datum: 25.09.2018 - 28.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - Population structure and allele frequency clines in wild and cultivated beets (Beta vulgaris) (Poster)
Autoren: McCann, J; Wascher, F; Stralis Pavese, N; Schulz, B; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2018
Datum: 25.09.2018 - 28.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - Benchmarking the impact of long-read correction methods (Poster)
Autoren: Peters, P; Stralis Pavese, N; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2018
Datum: 25.09.2018 - 28.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - Comparative genomics of the pathogenic bacterium Tannerella forsythia (Poster)
Autoren: Zwickl, NF; Stralis Pavese, N; Schäffer, C; Himmelbauer, H; Dohm, JC
Veranstaltung: German Conference on Bioinformatics 2018
Datum: 25.09.2018 - 28.09.2018 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2018 - A strategy for subgenome separation in Nicotiana benthamiana (Poster)
Autoren: Schiavinato, M; Dohm, JC; Gabaldón, T; Himmelbauer, H
Veranstaltung: XIV Symposium on Bioinformatics (JBI 2018)
Datum: 14.11.2018 - 16.11.2018 | Ort: Granada, Spain
Jahr: 2017 - Gene prediction and gene set analysis of Nicotiana benthamiana (Poster)
Autoren: Schiavinato, M; Strasser, R; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: Austrian Proteomics and Metabolomics Research Symposium APRS 2017
Datum: 06.09.2017 - 08.09.2017 | Ort: Graz, Austria
Jahr: 2017 - Genome analysis of wild and cultivated beets (Poster)
Autoren: Dohm, JC; Bodrug, A; Rodríguez del Río, A; McGrath, MJ; Schulz, B; Himmelbauer, H
Veranstaltung: NGS' 17: Structural variation and population genomics
Datum: 03.04.2017 - 05.04.2017 | Ort: Barcelona, Spain
Jahr: 2017 - Assembly of tetraploid quinoa and separation into ancestral sub-genomes (Poster)
Autoren: Bodrug, A; Minoche, AE; Bürstmayr, H; Gomez-Pando, L; Schmidt, T; Reinhardt, R; Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: ALPHY 2017: Bioinformatics and Evolutionary Genomics
Datum: 01.02.2017 - 03.02.2017 | Ort: Lyon, France
Jahr: 2016 - Pflanzenforschung und Pflanzenzüchtung im Zeitalter der Genomsequenzierung (Vortrag)
Autoren: Dohm, JC; Himmelbauer, H
Veranstaltung: 150 Jahre Mendelsche Regeln: Vom Erbsenzählen zum Geneditieren 2016
Datum: 17.03.2016 - 18.03.2016 | Ort: Vienna, Austria
Jahr: 2016 - Sugar Beet BeetMap-3, and Steps to Improve the Genome Assembly and Genome Sequence Annotation (W875) (Vortrag)
Autoren: Weisshaar, B; Himmelbauer, H; Schmidt, T; Holtgräwe, D; Minoche, AE; Dohm, JC; Stracke, R; Zakrzewski, F; Parol-Kryger, R; Stadermann, KB; Schneider, J; Rosleff Sörensen, T; Kraft, T; Schulz, B
Veranstaltung: 24th Plant & Animal Genome Conference 2016
Datum: 09.01.2016 - 13.01.2016 | Ort: San Diego, CA, USA
Jahr: 2016 - Analyzing the genomes of wild and cultivated beets (Poster)
Autoren: Dohm, JC; Bodrug, A; McGrath, JM; Schulz, B; Himmelbauer, H
Veranstaltung: 15th European Conference on Computational Biology (ECCB)
Datum: 03.09.2016 - 07.09.2016 | Ort: The Hague, Netherlands
Jahr: 2015 - Genomics and transcriptomics of the genus Beta using short and long sequencing reads (Poster)
Autoren: Dohm, JC; Peters, P; Minoche, AE; Postel, U; Kraft, T; Schulz, B; Schmidt, T; Weisshaar, B; Himmelbauer, H
Veranstaltung: PGEV 2015: 3rd Current Opinion Conference on Plant Genome Evolution
Datum: 06.09.2015 - 08.09.2015 | Ort: Amsterdam, Netherlands
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