BOKU - Universität für Bodenkultur Wien - Forschungsinformationssystem
Gewählte Diplomarbeit / Masterarbeit:
Sissy Pfeifer
(2008):
PCR-basierende Typisierung von Lactobacillen.
Diplomarbeit / Masterarbeit,
BOKU-Universität für Bodenkultur,
pp 376.
UB BOKU
obvsg
- Abstract:
- Ziel dieser Arbeit war es, eine robuste, PCR-basierende stammspezifische Typing-Methode für Lactobacillen zu entwickeln. Anhand eines Sets von probiotischen Prüfstämmen wurden verschiedene Einflussfaktoren, wie unterschiedliche Thermocycler, DNA Isolierungsmethoden, DNA Konzentration, PCR Puffer, DNA Polymerasen, Konzentration des PCR-Produkts und Auftrennungsmethoden, auf das durch rep PCR erhaltene Fingerprintmuster untersucht. Die Amplifikationsprodukte wurden durch Agarosegelelektrophorese und durch das Experion Elektrophorese System (BIORAD) und die QIAxcel Kapillarelektrophorese (QIAGEN) aufgetrennt. Fast alle Stämme der untersuchten Arten L. acidophilus, L. crispatus, L. gasseri, L. jensenii, L reuteri und L. rhamnosus konnten durch eine Kombination der Fingerprints mit dem (GTG)5 Primer, sowie dem Primerpaar REP1-Dt/REP2-Dt voneinander unterschieden werden. Zwei Stämme der Art L. rhamnosus konnten erst durch eine Sequenzierung der 16S rRNA differenziert werden. Außerdem wurden die mit dem (GTG)5 Primer und dem REP1-Dt/REP2-Dt Primerpaar erhaltenen Fingerprintmuster für ein Set von Stämmen jeweils mit deren Charakterdaten in einer Hauptkomponentenanlyse und einer Diskiminanzanalyse kombiniert.
- Beurteilende(r): Kneifel Wolfgang