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Oostenbrink Chris

Supervised Theses and Dissertations


2017

Jan Walther Perthold (2017): CALCULATION OF PROTEIN-PROTEIN BINDING FREE ENERGIES USING MOLECULAR DYNAMICS SIMULATIONS.
Master / Diploma Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 96. UB BOKU obvsg

Matthias Diem (2017): THE EFFECT OF CHANGES IN THE ENVIRONMENT ON THE STABILITY AND SURFACE PROPERTIES OF PROTEINS. STUDIED BY IN SILICO METHODS..
Master / Diploma Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 69. UB BOKU obvsg

Elisabeth Lobner
(2017): Enlightening the Fcab-antigen interaction via X-ray crystallography and biochemical studies.
Doctoral Thesis - Abteilung für Biochemie (DCH/BC), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 124. UB BOKU obvsg


2016

Daniel Fast (2016): Solvation free energies of amino acid analogues using molecular dynamics simulations.
Master / Diploma Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 52. UB BOKU obvsg

Bernhard Gasselhuber (2016): Structural and Mechanistic Studies on Eukaryotic Catalase-Peroxidase.
Doctoral Thesis - Abteilung für Biochemie (DCH/BC), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 207. UB BOKU obvsg FullText

Christian Margreitter (2016): From amino acids to proteins: on the parametrization and automation of molecular simulation.
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 268. UB BOKU obvsg FullText

Patrick Mayrhofer (2016): Engineering of critical antibody sequences for humanization, deimmunization and germinalization with detailed analysis of their influence on production cells.
Doctoral Thesis - Institut für Biotechnologie, BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 168. UB BOKU obvsg FullText


2015

Matthias Peter Gerstl (2015): Thermodynamic Metabolic Pathway Analyses Efficient Calculation of Biologically Feasible Elementary Flux Modes.
Doctoral Thesis - Institut für Biotechnologie, BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 91. UB BOKU obvsg FullText

Sylvia Helga Marija Dietrich
(2015): Novel bispecific SEED antibodies with specific light chain pairing.
Doctoral Thesis - Abteilung für Biochemie (DCH/BC), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 110. UB BOKU obvsg

Dagmar Brugger (2015): Engineering pyranose 2-oxidase for applications in biosensors and bio-fuelcells through modified oxygen reactivity.
Doctoral Thesis - Institut für Lebensmitteltechnologie, BOKU-Universität für Bodenkultur, pp XIV / 154 S.. UB BOKU obvsg


2014

Axel Sündermann (2014): Computer simulations of biomolecular and geochemical systems.
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 155. UB BOKU obvsg

Balder Yin-Wing Lai (2014): From model systems to biomolecular complexes Exploring entropy and protein stability.
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 154. UB BOKU obvsg

Christoph Hasenhindl
(2014): Library Design for Functional Engineering of IgG1-Fc by Experimental and Computational Means.
Doctoral Thesis - Abteilung für Biochemie (DCH/BC), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 167 . UB BOKU obvsg

Gabor Nagy (2014): Shapes and Free Energies of Biopolymers Computational Studies of Structure and Molecular Recognition.
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 187. UB BOKU obvsg

Melanie Grandits (2014): Modeling of Protein-Ligand Interactions: Applications and Use of Computational Resources.
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 161. UB BOKU obvsg


2013

Anita De Ruiter (2013): CALCULATION OF BINDING FREE ENERGIES FROM BIOMOLECULAR SIMULATIONS .
Doctoral Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 137. UB BOKU obvsg


2012

Michael Traxlmayr (2012): Stability engineering of IgG1-Fc by random mutagenesis and in vitro directed evolution.
Doctoral Thesis - Abteilung für Biochemie (DCH/BC), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 105. UB BOKU obvsg


2011

Melanie Grandits
(2011): Virtual screening for small molecule inhibitors of the NOPSI protein.
Master / Diploma Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 47. UB BOKU obvsg

Axel Sündermann
(2011): Structure and Dynamics of NOPSI-RNA Complexes.
Master / Diploma Thesis - Institut für Molekulare Modellierung und Simulation (MMS), BOKU-Universität für Bodenkultur, pp 42. UB BOKU obvsg

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