Vergleichende Glykomik ausgewählter Nematoden
- Lebensmittel, Ernährung, Gesundheit
- Biotechnologie
- Forschungscluster "Bioindustrielle Technologien"
Abstract
Nematoden, nicht-segmentierte Rundwürmer, haben sich im Laufe der Millionen Jahre dauernden Evolution an verschiedene ökologische Nischen angepasst. Viele Mitglieder dieser Organismen sind Parasiten - entweder von Menschen, Wirbellosen, Wirbeltieren oder Pflanzen während einige Nematoden einen frei lebenden Lebensstil aufweisen. Die parasitären Lebensformen haben sich innerhalb der Nematodenfamilie mehrmals unabhängig voneinander entwickelt und sind jetzt in vier der fünf Untergruppen anzutreffen. Oesophagostomum dentatum, der Knötchenwurm des Schweins, ein parasitärer Vertreter der Strongylida, einer Untergruppe des Nematoden Stammbaums, mit wesentlichen Säugetierparasiten und unmittelbaren Verwandten von Caenorhabditis elegans soll im Zentrum dieser Studie stehen. Die Oberfläche von Oesophagostomum dentatum, die großteils aus Glykoproteinen besteht, ist an das Immunsystem des Wirtes angepasst und verhindert die Ausbildung einer Immunität seitens des Wirtes. Besonders seine N-Glykan Epitope, Verzierungen der Proteinoberflächen, werden in Hinsicht auf ihre unterschiedliche Präsentation während der Entwicklung des Parasiten analysiert. Die spezifischen Epitope des invasiven dritten (L3) und des parasitären vierten (L4) Larvenstadiums, deren exkretorischen und sekretorischen Produkte als auch die geschlechtsspezifischen Ausprägungen der Darm bewohnenden adulten Würmer werden im Detail mit Hilfe von immunologischen, chromatographischen und massenspektrometrischen Verfahren untersucht. Im Vergleich von Oesophagostomum dentatum mit seinen frei lebenden nahen Verwandten wie dem Modellorganismus Caenorhabditis elegans, Caenorhabditis briggsae, Caenorhabditis remanei, Caenorhabditis japonica und Pristionchus pacificus sollen Epitope, die den parasitären Lebensstil unterstützen, definiert werden. Diese Studie soll dazu beitragen, die immunogenen und immunmodulierenden Glykane, der Nematoden besser zu verstehen.
Publications
Presence of galactosylated core fucose on N-glycans in the planaria Dugesia japonica
Autoren: Paschinger, K; Razzazi-Fazeli, E; Furukawa, K; Wilson, IBH Jahr: 2011
Journal articles
Presence of galactosylated core fucose on N-glycans in the planaria Dugesia japonica
Autoren: Paschinger K, Razzazi-Fazeli E, Furukawa K, Wilson IBH Jahr: 2011
Journal articles
The N-glycans of Trichomonas vaginalis contain variable core and antennal modifications.
Autoren: Paschinger, K; Hykollari, A; Razzazi-Fazeli, E; Greenwell, P; Leitsch, D; Walochnik, J; Wilson, IB; Jahr: 2012
Journal articles
Mass spectrometric analysis of the immunodominant glycan epitope of Echinococcus granulosus antigen Ag5.
Autoren: Paschinger, K; Gonzalez-Sapienza, GG; Wilson, IB; Jahr: 2012
Journal articles
Galactosylated Fucose Epitopes in Nematodes INCREASED EXPRESSION IN A CAENORHABDITIS MUTANT ASSOCIATED WITH ALTERED LECTIN SENSITIVITY AND OCCURRENCE IN PARASITIC SPECIES
Autoren: Yan, S; Bleuler-Martinez, S; Plaza, DF; Kunzler, M; Aebi, M; Joachim, A; Razzazi-Fazeli, E; Jantsch, V; Geyer, R; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2012
Journal articles
Complicated N-linked glycans in simple organisms.
Autoren: Schiller, B; Hykollari, A; Yan, S; Paschinger, K; Wilson, IB; Jahr: 2012
Journal articles
Mass spectrometric analysis of neutral and anionic N-glycans from a Dictyostelium discoideum model for human congenital disorder of glycosylation CDG IL.
Autoren: Hykollari, A; Balog, CI; Rendić, D; Braulke, T; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2013
Journal articles
Hemocytes and plasma of the eastern oyster (Crassostrea virginica) display a diverse repertoire of sulfated and blood group A-modified N-glycans.
Autoren: Kurz, S; Jin, C; Hykollari, A; Gregorich, D; Giomarelli, B; Vasta, GR; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2013
Journal articles
Array-assisted Characterization of a Fucosyltransferase Required for the Biosynthesis of Complex Core Modifications of Nematode N-Glycans
Autoren: Yan, S; Serna, S; Reichardt, NC; Paschinger, K; Wilson, IBH Jahr: 2013
Journal articles
N-glycomic profiling of a glucosidase II mutant of Dictyostelium discoideum by ""off-line"" liquid chromatography and mass spectrometry.
Autoren: Hykollari, A; Dragosits, M; Rendić, D; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2014
Journal articles
Two types of galactosylated fucose motifs are present on N-glycans of Haemonchus contortus.
Autoren: Paschinger, K; Wilson, IB; Jahr: 2015
Journal articles
Comparison of RP-HPLC modes to analyse the N-glycome of the free-living nematode Pristionchus pacificus
Autoren: Yan, S; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2015
Journal articles
Bisecting Galactose as a Feature of N-Glycans of Wild-type and Mutant Caenorhabditis elegans.
Autoren: Yan, S; Brecker, L; Jin, C; Titz, A; Dragosits, M; Karlsson, NG; Jantsch, V; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2015
Journal articles
Targeted release and fractionation reveal glucuronylated and sulphated N- and O-glycans in larvae of dipteran insects.
Autoren: Kurz, S; Aoki, K; Jin, C; Karlsson, NG; Tiemeyer, M; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2015
Journal articles
Comparisons of Caenorhabditis Fucosyltransferase Mutants Reveal a Multiplicity of Isomeric N-Glycan Structures
Autoren: Yan, S; Jin, CS; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2015
Journal articles
Sweet secrets of a therapeutic worm: mass-spectrometric N-glycomic analysis of Trichuris suis.
Autoren: Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2016
Journal articles
The fucomic potential of mosquitoes: Fucosylated N-glycan epitopes and their cognate fucosyltransferases.
Autoren: Kurz, S; King, JG; Dinglasan, RR; Paschinger, K; Wilson, IB; Jahr: 2016
Journal articles
Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry.
Autoren: Paschinger, K; Wilson, IB; Jahr: 2016
Journal articles
Structure and Biosynthesis of Complex N-Glycan Cores and Antennae in Nematodes. Experimental Biology, San Diego, April 2016.
Autoren: Yan S, Paschinger K and Wilson IBH* Jahr: 2016
Conference & Workshop proceedings, paper, abstract
Gender and developmental specific N-glycomes of the porcine parasite Oesophagostomum dentatum.
Autoren: Jiménez-Castells, C; Vanbeselaere, J; Kohlhuber, S; Ruttkowski, B; Joachim, A; Paschinger, K; Jahr: 2017
Journal articles
Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release
Autoren: Yan, S; Vanbeselaere, J; Jin, CS; Blaukopf, M; Wols, F; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2018
Journal articles
Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans
Autoren: Yan, S; Wang, H; Schachter, H; Jin, CS; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2018
Journal articles
Highly modified and immunoactive N-glycans of the canine heartworm
Autoren: Martini, F; Eckmair, B; Stefanic, S; Jin, CS; Garg, M; Yan, S; Jimenez-Castells, C; Hykollari, A; Neupert, C; Venco, L; Silva, DV; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2019
Journal articles
Project staff
Katharina Paschinger
Dipl.-Ing. Dr. Katharina Paschinger
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