Genomweite Assoziationsstudie für die Lebensdauer und verwandte Merkmale von Milchkühen

Die Lebensdauer einer Milchkuh ist ein Indikator ihrer Gesundheit und Fruchtbarkeit, ist aber auch essentiell für die Wirtschaftlichkeit des Betriebs ihres Halters. Die Schätzung von Zuchtwerten für die Lebensdauer von Kühen wird routinemäßig in vielen Staaten durchgeführt, wobei das infinitesimale genetische Modell mit additiver Wirkung sehr vieler Gene mit jeweils sehr kleiner Wirkung unterstellt wird und der Phänotyp eines Tieres und seiner Verwandten als Informationsquellen dienen. Die Heritabilitat für die funktionale Nutzungsdauer liegt bei 0.15, sodass die Suche nach Genen mit großer Wirkung durchaus Erfolg versprechend ist. Für die Kartierung von Genomregionen mit solchen Genen bei Fleckvieh und Braunvieh ist ein zweistufiges Verfahren geplant. In der ersten Stufe werden populationsweite Assoziationsanalysen für Nutzungsdauer und mit der Nutzungsdauer eine Reihe korrelierter Merkmale mit insgesamt 2500 Fleckvieh-Bullen und 1000 Braunvieh-Bullen durchgeführt. Genotypen für 54.000 SNP (single nucleotide polymorphism) Marker liegen bereits vor. Assoziationsanalysen werden sowohl für einzelne Marker als auch für Haplotypen durchgeführt, auch mit Einbeziehung der Verwandtschaftsinformation. In der Bestätigungsstudie der zweiten Phase werden Kühe mit extremen Phänotypen, jeweils 300 aus der Gruppe der ältesten lebenden 500 Kühe beider Rassen bei Populationsgrößen von 260.000 und 60.000 Tieren genotypisiert, die Daten werden mit Multi-SNP- und Haplotypen-Analysen ausgewertet. Weiters wird geprüft, ob Allelotypisierung mit DNA-Pooling der extremen Gruppen ähnliche Ergebnisse erbringt wie die Analyse nach individueller Genotypisierung. Dies ist wichtig für das zukünftige Mapping einer Reihe von Krankheiten, welche in Österreich im Rahmen des Gesundheitsmonitorings beim Rind für einen großen Teil der Population erhoben werden.