Glykoepitope von N-Glykanen in Echinodermata
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Abstract
In den vergangenen Jahren führten rapide Erkenntnisgewinne aus der Genomsequenzierung verschiedener Organismen und die daraus resultierenden Vergleichsmöglichkeiten zu einer geänderten Sichtweise über die Entwicklung und Verwandtschaft der Lebewesen. Im Gegensatz dazu ist der Vergleich von proteingebundenen Kohlenhydraten der Organismen aufgrund der komplexen Analytik ins Hintertreffen geraten und das obwohl Glykane in ihren verschiedenen Ausprägungen Schlüsselrollen in der (Zell)-Entwicklung spielen; speziell durch die Lokalisation an der Zelloberfäche sind sie an vielen primären Zell-Zell Wechselwirkungen beteiligt. Dieses Projekt befaßt sich mit den N-Glykanen der Echinodermaten, einer Gruppe mariner wirbelloser Organismen, die Seesterne und Seeigel umfaßt und im Stammbaum des Lebens in naher Verwandschaft zu den Chordata, zu denen die Wirbeltiere inklusive des Menschen gehören, steht. Trotz der wichtigen Stellung am Übergang zu den Wirbeltieren, der sicher durch neue ZellZell-wechselwirkungen markiert ist, existieren nur wenige Daten, die sich mit den Glykanen dieser Tiere beschäftigen, die sich in einer Grauzone zwischen den typisch Wirbellosen (wie Würmern und Insekten) und den Wirbeltieren befinden. Basierend auf den genomischen Daten des Seeigels (Strongylocentrotus purpuratus) und Lektinbindungsdaten von einer Seegurke kann man davon ausgehen, daß die Glykane auch der anderen Echinodermaten die Zuckerpitope Fucose und Sialinsäure enthalten. Speziell der letztgenannte Zucker wird sonst mit Wirbeltieren assoziert. Um die N-Glykane ausgewählter Echinodermaten in Detail zu studieren sollen diese nach verschiedenen Reinigungsschritten mittels Massenspektrometrie, MS/MS und HPLC- Analytik in Kombination mit enzymatischen und chemischen Behandlungen analysiert werden. Die neugewonnenen Daten über vorhandene Glykanepitope werden dann mit den phylogenetischen Daten in Verbindung gebracht um weitere Rückschlüsse auf die Entwicklung des Lebens am Schnittpunkt zu den Wirbeltieren zu ermöglichen.
- Glykomik
Publikationen
Targeted release and fractionation reveal glucuronylated and sulphated N- and O-glycans in larvae of dipteran insects.
Autoren: Kurz, S; Aoki, K; Jin, C; Karlsson, NG; Tiemeyer, M; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2015
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
More Than Just Oligomannose: An N-glycomic Comparison of Penicillium Species.
Autoren: Hykollari, A; Eckmair, B; Voglmeir, J; Jin, C; Yan, S; Vanbeselaere, J; Razzazi-Fazeli, E; Wilson, IB; Paschinger, K; Jahr: 2016
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Multistep Fractionation and Mass Spectrometry Reveal Zwitterionic and Anionic Modifications of the N- and O-glycans of a Marine Snail.
Autoren: Eckmair, B; Jin, C; Abed-Navandi, D; Paschinger, K; Jahr: 2016
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Analysis of zwitterionic and anionic N-linked glycans from invertebrates and protists by mass spectrometry.
Autoren: Paschinger, K; Wilson, IB; Jahr: 2016
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Hydrophilic interaction anion exchange for separation of multiply modified neutral and anionic Dictyostelium N-glycans
Autoren: Hykollari, A; Malzl, D; Yan, S; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2017
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Core Richness of N-Glycans of Caenorhabditis elegans: A Case Study on Chemical and Enzymatic Release
Autoren: Yan, S; Vanbeselaere, J; Jin, CS; Blaukopf, M; Wols, F; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2018
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
The parasitic nematode Oesophagostomum dentatum synthesizes unusual glycosaminoglycan-like O-glycans
Autoren: Vanbeselaere, J; Yan, S; Joachim, A; Paschinger, K; Wilson, IBH Jahr: 2018
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Isomeric separation and analysis of anionic and zwitterionic N-glycans from royal jelly glycoproteins
Autoren: Paschinger, K; Hykollari, A; Malzl, D; Eckmair, B; Vanbeselaere, J; Wilson, I Jahr: 2018
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Ablation of N-acetylglucosaminyltransferases in Caenorhabditis induces expression of unusual intersected and bisected N-glycans
Autoren: Yan, S; Wang, H; Schachter, H; Jin, CS; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2018
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Isomeric Separation and Recognition of Anionic and Zwitterionic N-glycans from Royal Jelly Glycoproteins
Autoren: Hykollari, A; Malzl, D; Eckmair, B; Vanbeselaere, J; Scheidl, P; Jin, CS; Karlsson, NG; Wilson, IBH; Paschinger, K Jahr: 2018
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Tissue-specific glycosylation in the honeybee: Analysis of the N-glycomes of Apis mellifera larvae and venom
Autoren: Hykollari, A; Malzl, D; Stanton, R; Eckmair, B; Paschinger, K Jahr: 2019
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Mitarbeiter*innen
Katharina Paschinger
Dipl.-Ing. Dr. Katharina Paschinger
katharina.paschinger@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-77216, 77217
Projektleiter*in
01.12.2013 - 30.06.2018