Struktur und Funktionsuntersuchungen an einer dimeren Chloritdismutase
Abstract
Die Belastung von Trinkwasser, Grundwasser und Böden durch Chlorit (ClO2-) wird zu einem immer größer werdenden Umweltproblem, da Chlorit wegen seiner oxidativen Eigenschaften für lebende Zellen toxisch ist. Interessanterweise können viele Bakterienarten aber Chlorit mit Hilfe eines Enzyms namens Chloritdismutase in harmloses Chlorid (Cl-) und Sauerstoff (O2) abbauen. Dabei wird eine O-O Bindung gebildet, eine Reaktion wie sie bisher nur in phototrophen und sauerstofffreisetzenden Organismen (z.B. Pflanzen) beobachtet werden konnte. Aufgrund dieser einzigartigen Eigenschaften könnte Chloritdismutase in Zukunft beim Abbau von Chlorit in Trinkwasser oder als Generator von O2 in verschiedensten biotechnologischen Anwendungen eingesetzt werden. Dazu ist es aber nötig, die Struktur-Funktionsbeziehungen in diesem biologischen Katalysator besser zu verstehen. Ziel dieses Projektes ist es daher, den genauen Mechanismus des Chloritabbaus durch Chloritdismutase herauszufinden. Es ist bereits gelungen, das Enzym funktional in großen Mengen rekombinant herzustellen und dessen dreidimensionale Struktur in atomarer Auflösung aufzuklären. Dies ist nun eine ausgezeichnete Voraussetzung, die molekularen Teilschritte und Enzymintermediate, die Chloritdismutase beim Abbau des Substrats durchläuft, zu eruieren. Hier ist festzuhalten, dass dazu widersprüchliche Hypothesen in der Fachliteratur kursieren und unklar ist, ob z.B. Chlormonoxid oder Hypochlorit als Zwischenprodukt entsteht, oder warum und wie das Enzym bei höheren pH-Werten inaktiviert wird. Ein Projekt im Forschungsbereich der molekularen Katalyse benötigt die umfassende Anwendung vieler biochemischer und biophysikalischer Methoden: (i) rekombinante Produktion des Wild-Typ Enzyms und von Einzelmutanten; (ii) die Charakterisierung dieser Eisenproteine mit verschiedensten spektroskopischen und electrochemischen Methoden, um die Struktur und Reaktivität des aktiven Zentrums besser zu verstehen; (iii) Analyse der individuellen Reaktionsschritte und Charakterisierung der elektronischen Struktur der Redoxintermediate, die für die Katalyse relevant sind, z.B. durch Stopped-flow Spektroskopie; und (iv) die Aufklärung der Röntgen- und Neutronen-Kristallstrukturen. Diese Arbeiten werden in enger Zusammenarbeit mit international anerkannten Spezialisten aus Österreich, Italien, Belgien und USA durchgeführt. Das erworbene Wissen über Struktur und Funktion von Chloritdismutase wird die Basis liefern sowohl zum Verständnis der physiologischen Rolle dieser Enzyme in Bakterien als auch zu möglichen biotechnologischen Anwendungen wie z.B. der Dekontamination von verseuchtem Trinkwasser.
Molekulare Enzymologie Biomolekulare Spektroskopie Hämprotein Chloritdismutase Strukturbiologie
Publikationen
Crystal and Electronic Structure of Compound I in Dye-decolorizing Peroxidases
Autoren: Pfanzagl, V; Hofbauer, S; Beale, J; Mlynek, G; Michlits, H; Nys, K; Van Doorslaer, S; Djinovic-Carugo, K; Furtmüller, PG; Obinger, C Jahr: 2018
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Kinetic and spectroscopic characterization of EfeB
Autoren: Michlits, H., Pfanzagl, V., Schwaiger, L., Furtmüller, P. G., Hofbauer, S., Obinger, C. Jahr: 2018
PUBLIZIERTER Beitrag für wissenschaftliche Veranstaltung
Arresting the Catalytic Arginine in Chlorite Dismutases: Impact on Heme Coordination, Thermal Stability, and Catalysis.
Autoren: Schmidt, D; Serra, I; Mlynek, G; Pfanzagl, V; Hofbauer, S; Furtmüller, PG; Djinović-Carugo, K; Van Doorslaer, S; Obinger, C; Jahr: 2021
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Impact of the dynamics of the catalytic arginine on nitrite and chlorite binding by dimeric chlorite dismutase.
Autoren: Serra, I; Schmidt, D; Pfanzagl, V; Mlynek, G; Hofbauer, S; Djinović-Carugo, K; Furtmüller, PG; García-Rubio, I; Van Doorslaer, S; Obinger, C; Jahr: 2022
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Mitarbeiter*innen
Christian Obinger
Univ.Prof. Mag. Dr.rer.nat. Christian Obinger
christian.obinger@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-10011, 77273
Projektleiter*in
01.01.2018 - 31.12.2020