Wurzelforschung 4.0 - Automatisierung der Erfassung und Analyse von Minirhizotron-Bildern
Abstract
Das Projekt wird ein automatisierbares, modulares Minirhizotron (MR) -Bilderfassungssystem für in situ Studien und eine begleitende Softwarelösung zur Automatisierung der Wurzelanalyse und der Bestimmung des Bodenwassergehalts entwickeln. Ziele: - Entwurf und Bau des Prototyp eines autonomen und modularen MR-Kameraträgersystems für die dauerhafte Installation in situ - Entwicklung von zwei Kameramodulen die mit dem Trägersystem verwendet werden sollen, i.e. o kostengünstiges VIS RGB-basiertes UHD-Modul, und ein o erweitertes Kamera-Modul, das RGB und ausgewählte multispektrale (NIR) Wellenbereiche für die erweiterte Bildanalyse kombiniert. - Entwicklung eines neuronalen Netzwerk-basierten Analyse-Workflows zur o Wurzelsegmentierung und Bestimmung des Bodenwassergehalts, und o Wurzelklassifizierung sowie Bestimmung des Bodenwassergehalts aus MR-Bildern.
Publikationen
Automatizing MiniRhizotron Image Acquisition
Autoren: Rewald, B; Lazarovitch, N; Baykalov, P; Hadar, O; Mayer, S; Bodner, G; Seehra, L Jahr: 2020
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Convolutional neural network-based automatic root length measurement in noisy rhizosphere images
Autoren: Soffer, A; Parthasarathi, T; Lasri, A; Hadar, O; Rewald, B; Bodner, G; Baykalov, P; Ephrath, J; Lazarovitch, N Jahr: 2020
Originalbeitrag in Fachzeitschrift
Enabling next level research on roots: Automatizing Minirhizotron Image Acquisition and Analysis (NextMR-IAA) for Research and Agricultural Management
Autoren: Rewald, B; Seehra, L; Hadar, O; Sofer, A; Baykalov, P; Elmakies, M; Bodner, G; Zhou, K; Lazarovitch, N Jahr: 2020
Projektbericht
Mitarbeiter*innen
Boris Rewald
Assoc. Prof. Dipl.-Biol. Dr.rer.nat. Boris Rewald
boris.rewald@boku.ac.at
Projektleiter*in
01.05.2019 - 31.10.2020
Gernot Bodner
Priv.-Doz. Dr. Gernot Bodner
gernot.bodner@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-95115
Sub-Projektleiter*in
01.05.2019 - 31.10.2020
Pavel Baykalov
Pavel Baykalov MSc.
pavel.baykalov@boku.ac.at
Projektmitarbeiter*in
02.09.2019 - 31.12.2019
BOKU Partner
Externe Partner
Ben-Gurion Universität
Naftali Lazarovitch
Partner
Vienna Scientific Instruments GmbH
Liaqat Seehra
Partner