Metabolomics of plant-Fusarium interactions
Abstract
Das interdisziplinäre Projekt SFB Fusarium wird von Prof. Gerhard Adam koordiniert und hat zum Ziel mit Hilfe der Genomik, Transkriptomik und Metabolomik zu einem verbesserten Verständnis der komplexen Pathogen-Wirt-Beziehung zwischen Weizen und dem phytopathogenen Pilz Fusarium graminearum (Fg) beizutragen. Eine der zentralen Arbeitshypothesen des Metabolomics-Subprojekts lautet, dass Fg in der Lage ist mehrere (unbekannte) niedermolekulare Metabolite zu bilden, die als Effektoren wirken indem sie die Abwehrreaktion der infizierten Pflanze stören oder unterdrücken. Um dies zu erforschen verwenden wir unsere Stabilisotopen unterstuetzte Metabolomcs-Platform um mutmaßliche bioaktive, vom Pilz stammende Polyketide aufzuspüren und ihr Wirkpotenzial als Effektor-Moleküle zu testen. Darüber hinaus gehen wir der Frage nach inwiefern Fg Metabolite synergistische Wirkung besitzen, indem sie zusammenwirken um ihrer Inaktivierung durch die Pflanze zu entgehen. Auf der Pflanzenseite werden wir 13C matkierte Tracersubstanzen verwenden um deren Metabolisierung / Entgiftung in planta zu studieren und die zugrunde liegenden Resistenz-vermittelnden Stoffwechselwege zu erforschen. Zu diesem Zweck haben wir eine eigens dafür entwickelte Pflanzen-Wachstumskammer zur Verfügung, die die Kultivierung vollständig 13C und 15N markierter Pflanzen unter experimentellen Bedingungen ermöglicht. Wir gehen davon aus, dass die im Rahmen dieses Projekts zu generierenden neuen Erkenntnisse rauf lange Sicht dazu beitragen das Fusarium-Problem zu beseitigen, indem die Grundlage fuier eine wissensbasierte Pflanzenschutzstrategien erarbeitet werden. Schließlich planen wir in Zusammenrabeit mit den kollegInnen von der Uni Wien die ungerichtete 13C Tracer-Methode einzusetzen um die bisher unbekannte Toxizät und Versoffwechselung kürzlich entdeckter sekundärer Fusarium-Metabolite in Säugerzelllinien zu untersuchen.
Chromatographie Massenspektrometrie Isotopenmarkierung Schadpilz Pflanze
Publikationen
Mitarbeiter*innen
Rainer Schuhmacher
Univ.Prof. Dipl.-Chem. Dr. Rainer Schuhmacher
rainer.schuhmacher@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-97307
Projektleiter*in
01.03.2016 - 28.02.2019
Christoph Büschl
Dr. Christoph Büschl MSc.
christoph.bueschl@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-97304
Projektmitarbeiter*in
01.03.2016 - 28.02.2019
Chala Furgassa Diririssa
Chala Furgassa Diririssa B.Sc.
Projektmitarbeiter*in
01.03.2016 - 28.02.2019
Maria Doppler
Dr. Maria Doppler MSc.
maria.doppler@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-35072
Projektmitarbeiter*in
01.03.2016 - 28.02.2019