Entwicklung einer genomischen Zuchtwertschätzung für Fleckvieh
Abstract
Die Nutzung molekularer Marker zur besseren Beschreibung des Zuchtwertes von Tieren wird seit vielen Jahren diskutiert und untersucht. Die Entwicklung von Hochdurchsatzmethoden zur kostengünstigen Bestimmung von sehr vielen Markern (SNPs – single nucleotide polymorphisms) erlaubt die Genotypisierung von etwa 50.000 SNPs. Diese Marker-Dichte hat die Möglickeit der genomischen Selektion eröffnet. Dabei wird nicht mehr nach einzelnen Genen gesucht, sondern simultan die Information von vielen Markern genutzt, um den Zuchtwert eines Tieres zu schätzen. Ziel des vorliegenden Projektes ist die Entwicklung von Formeln für die genomische Zuchtwertschätzung. Dazu werden etwa 1.000 Fleckviehstiere mit einem 50.000 SNP-Chip genotypisiert werden. Für die Entwicklung der Formel für die genomische Zuchtwertschätzung werden folgende statistische Methoden verglichen werden: Regression mit Hauptkomponenten, Partial least squares, multiple Regression mit der Suche der Regressionsfaktoren mit einem genetischen Algorithmus und multiple Regression mit der Variablen-Selektion nach der Methode der Least Angle Regression. Die molekulare Information soll optimal mit der über die Leistungsprüfung verfügbaren phänotypischen Information für die Zuchtwertschätzung kombiniert werden. Weiters wird der potentielle Nutzen dieser Technologie zur genetischen Verbesserung von niedrig heritablen Merkmalen, unter besonderer Berücksichtigung von Gesundheitsmerkmalen geprüft.
Rind SNP genomische Selektion Zuchtwertschätzung
Publikationen
Mitarbeiter*innen
Johann Sölkner
Univ.Prof. Dipl.-Ing. Dr.nat.techn. Johann Sölkner
johann.soelkner@boku.ac.at
Tel: +43 1 47654-93201, 93231
BOKU Projektleiter*in
01.03.2008 - 28.02.2011
BOKU Partner
Externe Partner
ZuchtData Dienstleistungen GMbH
Dr. Christa Egger-Danner
Koordinator